[3] Además, el material genético de Aigarchaeota ha sido encontrado en muestras tomadas de ambientes geotermales tanto terrestres como marinos, a lo largo del mundo, lo que permitiría distinguir por lo menos tres familias.
Los análisis genéticos realizados apoyan la pertenencia de Caldarchaeales en Nitrososphaeria o Thaumarchaeota.
Las características estruturales de estas proteínas son más parecidas a los sistemas eucarióticos que a los procarióticos.
Los genes encontrados en el genoma de Caldiarchaeum subterraneum sugieren que podría crecer quimiolitotróficamente utilizando hidrógeno o monóxido de carbono como donante de electrones, mientras que usaría oxígeno y nitrito como aceptores de electrones.
[3] Algunos autores opinan que en realidad este supuesto grupo forma parte de Nitrososphaeria o Thaumarchaeota y que Caldiarchaeum subterraneum debe ser clasificado como Nitrososphaeria.