Algunas de las ramificaciones del rizoma crecen erectas al suelo formado un tronco vertical hueco organizado también en entrenudos y nudos.

En los nudos desarrolla ramificaciones primarias similares y hojas en verticilos o estróbilos portadores de esporangióforos.

[1]​ Así Calamites presenta un tronco o fuste erecto formado por nudos y entrenudos bien caracterizados.

[2]​ Los fustes de Calamites poseían una gran cavidad interna que se extendía longitudinalmente y sin interrupción desde la base hasta el ápice.

Hacia el exterior se ha observado la presencia de xilema secundario y una epidermis lisa o longitudinalmente estriada.

El subgénero Stylocalamites posee ramificaciones escasas e irregularmente insertas en el eje principal.

Los rizomas aunque similares en apariencia a tallos no presentan el hueco central característico.