En el año 2006 el centro fue transformado en servicio autónomo pasando a llamarse "SACAICET" (Servicio Autónomo Centro Amazónico de Investigación y Control de Enfermedades Tropicales “Simón Bolívar”), manteniéndose su adscripción al Ministerio de Salud.

En 1975 se descubrió un foco de oncocercosis (ceguera de los ríos) en la población yanomami del entonces llamado Territorio Federal Amazonas (TFA, actualmente Estado Amazonas).

Las actividades iniciales de esa investigación revelaron que, además de la oncocercosis, la malaria, la leishmaniasis, las parasitosis intestinales, la hepatitis B, la gripe, el sarampión y la tos ferina constituían importantes problemas de salud para la población del territorio, afectando particularmente a los pueblos originarios radicados en el área.

[4]​[8]​ Ante ello, propusieron la creación de un programa más amplio de investigación y atención médica en enfermedades infecciosas denominado PROICET-Amazonas.

La obra se concretó en seis meses, siendo inaugurada el 12 de octubre de 1982,[1]​ con lo cual la infraestructura física del programa quedó compuesta por las instalaciones del CAICET en Puerto Ayacucho, 2 laboratorios situados en Caracas, 3 ambulatorios rurales del alto Orinoco, 1 vehículo automotor; 1 embarcación fluvial con laboratorio y 2 embarcaciones tipo "curiara" (hechas en troncos ahuecados), todo ello coordinado desde la sede de CAICET.