La religión tradicional de los pueblos mongoles fue el chamanismo, que aún influye en la cultura mongola y en su budismo, y es practicado por una minoría dentro de Mongolia.

Sin embargo, el budismo tibetano es la religión tradicional y predominante seguida por el 93% de la población.

El budismo tibetano fue la religión oficial del Imperio mongol con su propio líder espiritual, llamado Jebtsundamba Kutuktu.

Robert Rupen calcula que había 110.000 monjes budistas en Mongolia, que en algunas ocasiones ejercían como gobernantes políticos, y cerca de 250.000 personas viviendo en territorios pertenecientes al clero budista.

En 1992 el comunismo cayó en Mongolia y fue reemplazado por un gobierno democrático parlamentario, declarado Estado laico -por lo que oficialmente no patrocina ninguna religión- pero aun así, el gobierno mongol financia la restauración de monasterios budistas por su valor histórico.