Se tienen contabilizados 104 cenotes, el municipio forma parte de la Cuenca Yucatán de la Región hidrológica Yucatán Norte.

[9]​ El clima es subhúmedo con lluvias entre mayo y julio, es decir, en la primera parte del verano.

La vegetación se clasifica como selva baja caducifolia, los ejemplares más altos pueden alcanzar los 15 metros de altura; y las clases más comunes en la zona son amapola, chechén, colorín, ceiba y pucté.

Al respecto de la fauna se pueden encontrar pequeños mamíferos, reptiles y aves.

[10]​ En Buctzotz se encuentran un total de dieciocho localidades, las principales y su población total en 2005 son: Formado por un presidente municipal y siete regidores y un secretario, quienes determinan la normatividad para Desarrollo urbano, obras públicas, servicios públicos, ecología, parques, aseo urbano, nomenclatura y cementerio.