Hayden creció en Mission, Columbia Británica y comenzó a nadar cuando tenía cinco años.

Asistió a la Universidad de la Columbia Británica durante un año.

El club Mission Marlins renombró la competición que organiza como "Brent Hayden Invitational".

Aunque se clasificó para las semifinales de la prueba de 200 m con el tercer mejor tiempo (Michael Phelps lo hizo con el cuarto), su entrenador decidió que no tomara parte en las mismas para estar descansado en la prueba de 4 × 100 m, que se celebraba el mismo día.

En la prueba individual de 100 m libre no se clasificó para la final.