Se desempeñó como productor ejecutivo en las series de Fox Prime Time, Cosmos: Mundos posibles, Cosmos: Una Odisea del Espacio Tiempo, un relanzamiento de la miniserie que en 1980 presentara por Carl Sagan.

[5]​ Braga comenzó como pasante en Star Trek: The Next Generation en 1990, convirtiéndose finalmente en productor ejecutivo.

Formó parte del equipo creativo nominado para un premio Emmy en horario estelar en 1994 por Serie de Dramática y ganó el Premio Hugo a la Mejor Presentación Dramática en 1995 por su trabajo en el capítulo final de Star Trek: The Next Generation llamado "All Good Things...." (Todas las cosas buenas ) junto con su colaborador de muchos años Ronald D.

Se desempeñó como showrunner para Voyager hasta el final de la sexta temporada cuando comenzó a trabajar en lo que luego sería Star Trek: Enterprise.

En 2014, dirigió el video musical de Marilyn Manson "Cupid Carries a Gun" del álbum The Pale Emperor.