El territorio habitado primero por los indios tuxás, Botuporã fue colonizado a mediados del siglo XVIII por los portugueses.

La ciudad nació con el primer nombre de Fazenda Caititu, fundada por los colonizadores portugueses Marques y Castros.

Con el tiempo, el lugar prosperó y otras propiedades surgieron a su alrededor, formando un pequeño núcleo urbano.

[7]​ En 1926, los misioneros ordenaron abrir un camino hasta una colina existente en el pueblo, donde construyeron una cruz que se llamó Monte Belo.

El pueblo se desarrolló en función de la agricultura y la ganadería, convirtiéndose en distrito.