El Bosque Deschutes alberga áreas oficiales de preservación, diversas actividades biológicas y recreativas.

Hay cinco áreas silvestres designadas oficialmente por el Sistema Nacional de Preservación de Áreas Silvestres que se superponen al bosque y se comparten administrativamente con Bosques Nacionales circunvecinos.

Entre ellos: Hace unos 7.700 años, la erupción del monte Mazama (que formó lago del Crater, al sur del bosque nacional) cubrió el suelo existente con aproximadamente 3 pies (0,9 m) de ceniza volcánica y piedra pómez, formando una capa superficial bastante inhóspita para las plantas, aunque con la capa subyacente sigue siendo accesible a las raíces y crecimiento vegetal.

[11]​ Se venden permisos para recolectar hongos, y la recolección comercial está prohibida en la mayoría de las áreas oficiales.

Otros hongos comparten un sistema de permisos con los bosques nacionales Fremont-Winema, Umpqua y Willamette.

[12]​ Los animales que se encuentran en el bosque incluyen alces, ciervos y ranas.

[8]​ El bosque nacional sufre de frecuentes incendios forestales, empeorando en años recientes en comparación con todas las eras del pasado.