Tras estudiar Arte Dramático durante tres años, empezó a trabajar para la televisión como fotógrafo y operador de cámara.

De regreso a España, Zambrano comenzó a preparar su primera película como director, Solas, que obtuvo un gran éxito.

A continuación, en 2002, logró el éxito de nuevo con la aclamada miniserie de televisión Padre Coraje, así como con sus otros dos largometrajes: Habana Blues (2005), un retrato de dos músicos cubanos que fue presentado en la sección “Un Certain Regard” del Festival de Cannes, y La Voz Dormida (2011), un drama enmarcado en la guerra civil española.

[4]​ Su película titulada Intemperie (2019) recibió 5 nominaciones[5]​ a los Premios Goya, ganando finalmente el Premio Goya a Mejor Guion Adaptado (escrito por el propio Benito Zambrano junto a los hermanos Daniel y Pablo Remón)[6]​ y el Premio Goya a Mejor Canción Original por "Intemperie" compuesta por Javier Ruibal e interpretada por Silvia Pérez Cruz.

[7]​ Este largometraje, como el resto de su filmografía, se centra en la supervivencia y en cómo los individuos se enfrentan a las injusticias de la sociedad.