Ordenado sacerdote, fue nombrado predicador y capellán de esta universidad, así como catedrático, llegando a ser vicerrector en 1515.

Allí tuvo gran éxito al sumarse a una campaña contra los judíos que culminó con el despojo de la sinagoga y su conversión en una capilla, en la cual se aseguraba que ocurrieron 54 milagros.

Desde marzo de 1523 se relacionó con Ulrico Zuinglio y en octubre de ese año participó en un debate en Zúrich, en el que manifestó su seguimiento a la Biblia y dejó entrever que no compartía el bautismo infantil.

En Waldshut se dedicó a preparar un programa para la Reforma en toda la región, para lo cual redactó 18 artículos normativos, entre los que se encontraban la justificación por la fe, la exigencia de fe viva manifestada en el amor al prójimo, el bautismo por voluntad propia y el rechazo al celibato sacerdotal obligatorio.

Zuinglio respondió con otro folleto, donde manifestaba que los anabaptistas destruirían el orden social si se les dejaba actuar.

Apenas se recuperó de una enfermedad que padecía, volvió a rechazar el bautismo infantil, por lo cual fue encarcelado y torturado en el "potro" hasta que firmó una retractación, tras lo cual salió de la ciudad hacia Moravia y se refugió en Nikolsburg (hoy Mikulov, República Checa).

Desde 1619 sus obras están incluidas en el Índice de Libros Prohibidos por la Iglesia católica.