Posteriormente fue designado como imám y principal orador de la mezquita del Imam al Baquir de Latakia; desde este cargo se dedicó a promover el espíritu ecuménico entre los diferentes credos religiosos que conviven en Siria.

[3]​ En principio se barajaron varias hipótesis respecto a la identidad de sus captores, llegándose a afirmar que se podía tratar tanto de hombres del Estado Islámico de Irak y el Levante como del Frente de la Victoria para el Pueblo de Gran Siria; posteriormente se daría conocer que los autores del rapto eran miembros del grupo Movimiento Islámico del Levante.

Durante el tiempo que duró el cautiverio se emitieron al menos dos vídeos en que se mostraban a Badr al-Din Ghazal aún con vida.

La noticia fue confirmada cuando el mismo grupo reveló una foto de los despojos mortales de Badr al-Din Ghazal acompañada de una leyenda en la que se podía leer: ¨!este será el final y el destino de todos los que están tras Bashar y le brindan ayuda en la guerra contra el Islam y su gente!¨.

[6]​ Más allá de la violencia sectaria y la persecución en contra de la comunidad alawita por parte de grupos extremistas sunitas se ha llegado a señalar que el secuestro de Badr al-Din Ghazal se pudo deber a un error respecto a su identidad, siendo confundido con otro importante clérigo alawita, el sheik Muwafaq Ghazal, con quien no solo comparte el mismo apellido sino cierto parecido físico.