Junto con Palaeopropithecus, Archaeoindris y Mesopropithecus, forma la familia Palaeopropithecidae, conocidos con el nombre de lémures perezoso.

A causa de su mezcla de caracteres morfológicos que representan etapas intermedias entre los índridos vivientes y los grandes lémures perezoso, ha contribuido a aclarar la relación entre ambos grupos y los cercanos lémures babuino, también extintos.

Babakotia radofilai era un animal mayoritariamente folívoro, aunque también comía fruta y raíces duras.

[5]​ Babakotia radofilai es el único miembro del género Babakotia y pertenece a la familia de los paleopropitécidos, que incluye otros tres géneros de lémur perezoso: Palaeopropithecus, Archaeoindris y Mesopropithecus.

Babakotia y Mesopithecus no solo compartían la dentición de los índridos, sine que también la forma del cráneo.

[6]​ En muchos aspectos tenía un nivel intermedio de adaptaciones para un comportamiento suspensor entre los lémures perezoso grandes y los pequeños.

[11]​ Además, análisis de los canales semicirculares,[12]​ vértebras lumbares y procesos espinosos indican un movimiento lento y adaptaciones para trepar (antipronogradismo), pero no necesariamente para agarrarse verticalmente de manera similar a los perezoso o para saltar.

[7]​ Daubentoniidae †Megaladapidae Lemuridae Cheirogaleidae Lepilemuridae †Archaeolemuridae †Mesopropithecus †Babakotia †Palaeopropithecus †Archaeoindris Indriidae Todos los lémures perezoso tienen un cráneo similar al de los índridos, aunque un poco más robusto.

[6]​ Los caracteres craneales que comparte con los otros lémures perezoso incluyen órbitas relativamente pequeñas, arcos zigomáticos robustos y uno paladar duro bastante rectangular.

[3]​ Junto con el tamaño relativo del canal óptico, las órbitas pequeñas sugieren que B. radofilai tenía una agudeza visual baja, cosa habitual en los lémures.

[16]​[9]​[21]​ [6]​ En todos los lémures perezoso, incluyendo B. radofilai, los dientes permanentes surgen pronto, un carácter observado en los indris y que mejora las posibilidades de supervivencia durante la primera estación seca después del destete.