El valle donde se encuentra el pueblo ocupa casi todo el sector noreste del término.
Según Joan Coromines, el topónimo Bóixols es de origen románico y tiene sus raíces en la palabra románico que designa el arbusto o arbolito del boj, muy abundante en estas tierras.
El final en "-ols" debe ser un diminutivo (en catalán), posiblemente con el valor de colectivo.
Coromines también destaca que el valle de Bóixols comienza en el cuello de Boix, cosa que refuerza la evidencia del origen del topónimo.
Es un topónimo que se presenta ya desde antes con la forma actual, o casi: Boxols (años 839, 997, 1076, 1094, 1359), Buxiles (961)