Comenzó su carrera como periodista en el Daily News de Nueva York.

Entre 1994 y 2000 fue editor de DC Comics, publicando numerosos cómics de la línea Vertigo, como Doom Patrol, Animal Man, Hellblazer, Predicador y 100 balas.

[1]​ El padre de Alonso es mexicano, y su madre es británica.

Supervisó también etapas aclamadas por la crítica, como The Amazing Spider-Man de Joseph Michael Straczynski y X-Men: Messiah Complex y Maldición de los mutantes.

De esta manera, Alonso se convirtió en la tercera persona en acceder al cargo en 15 años.