Militó tres años en Primera División y luego descendió a su liga de origen hasta desaparecer.

La fusión se produjo luego de que ambos equipos no lograran el ascenso a Primera en el Torneo Zonal 1992.

En el Descentralizado del mismo año, el club fue relegado a la Copa Perú, en la cual se mantuvo durante siete años hasta desaparecer definitivamente en el 2003.

E incluso la Copa Perú 1993 ganada por el Aurich-Cañaña también es atribuida ocasionalmente de manera errónea al palmarés oficial del Juan Aurich.

Luego de que el Aurich-Cañaña descendiera a la Copa Perú en 1996, al año siguiente el Juan Aurich y el Deportivo Cañaña —clubes que desaparecieron luego de fusionarse para dar origen al Aurich-Cañaña en 1992—[2]​ decidieron reaparecer nuevamente y volvieron a participar en el fútbol peruano; Juan Aurich lograría ser campeón de la Copa Perú 1997 y pudo ascender a la Primera División,[3]​ mientras que el Deportivo Cañaña se mantendría en la Copa Perú.

Sin embargo, pese a que los equipos Juan Aurich y Deportivo Cañaña habían regresado al fútbol, el Aurich-Cañaña siguió participando en la Copa Perú hasta el 2003, año en el que decidió venderle la categoría a la Universidad de Chiclayo, desapareciendo así definitivamente del fútbol.

Luego, el diseño se modifica a un escudo circular de color blanco, con la silueta del gallo y las letras A.C.