En su primer año en la máxima categoría del fútbol sala español realizó una buena campaña, acabando 8.º y clasificándose para el playoff por la liga.
Cayó en cuartos de final frente a ElPozo Murcia por 2-0.
En la temporada 2002/03, la última del equipo, hizo un papel digno, salvando la categoría con una 11.ª posición, pero peor que en las dos campañas anteriores, En total, jugó 3 temporadas en División de Honor.
Desaparece en 2004, cuando el Atlético Boadilla y el Club Fútbol Sala Las Rozas se fusionan con la idea de ser más fuertes de cara al futuro, formando el UD Boadilla Las Rozas.
[1] Este club participó en División de Honor en la temporada 2004/2005 con la plaza del Atlético Boadilla, no pudiendo mantener la categoría y descendiendo a División de Plata.