Argento Soma está basado en la novela clásica de terror Frankenstein.
La historia empieza en el año 2054, cuando unos alienígenas de gran tamaño invaden la tierra.
Tras esta primera invasión que presumimos fue rechazada, aparecen con cierta periodicidad alienígenas desde el espacio que se dirigen sin excepción a un lugar del noroeste de los Estados Unidos denominado "punto Pilgrimage".
El protagonista de la historia se llama Kaneshiro Takuto, un joven estudiante que trabaja en un proyecto científico relacionado con la metalurgia.
Su novia, Agata Maki estudia con el Profesor Noguchi en el departamento de biomecánica.