Las frondas grandes estaban densamente fijadas con folíolos en forma de abanico en tallos que se inclinaban bruscamente hacia arriba.

Los folíolos, o pínulas, se solapaban entre sí y eran subcirculares a forma de cuña.

La planta tenía zonas nodales que habrían sido sitios importantes para el posterior desarrollo de las raíces y las ramas laterales.

Algunas ramas eran latentes y adventicias, similares a las producidas por los árboles vivos que eventualmente se convierten en raíces.

Antes de este tiempo, las raíces rizoma poco profundas habían sido la norma, pero con Archaeopteris se estaban desarrollando sistemas de raíces más profundas que podrían soportar un crecimiento cada vez mayor.

[1]​ Scheckler cree que Archaeopteris tuvo un papel importante en la transformación de su entorno.

Se cree que esto representa un primer paso en la evolución de las plantas vasculares hacia la reproducción por semillas, que aparecieron por primera vez en el grupo de gimnospermas, los helechos semilleros (Pteridospermae).

Llamó a la madera Callixylon, aunque no encontró más estructuras que el tronco.