En 2007 fichó por el equipo español Sevilla, donde jugó durante dos temporadas.

[4]​ Mosquera ganó el campeonato Clausura 2013, anotando un gol en el partido de vuelta de la final a tan solo dos minutos del final del tiempo regular, el cual fue decisivo para la eventual remontada del América frente a Cruz Azul.

En junio de 2016 se confirma como nuevo jugador del Deportivo Cali pedido por el técnico Mario Yepes.

En general, no tuvo un buen paso por el equipo caleño.

Aquivaldo Mosquera ha sido convocado a la selección colombiana en varias ocasiones, incluso a las eliminatorias para el Mundial de 2010, para el Mundial de 2014 y para varios amistosos.