El Appenzeller es utilizado en recetas como la Fondue y la Raclette.

El nombre de Appenzeller es otorgado por la región en donde éste es preparado desde la Edad Media, el Appenzellerland.

El queso fue mencionado por primera vez en un escrito hace unos 700 años.

El tiempo de maduración se extiende por lo menos durante tres meses, durante la maduración la corteza es untada regularmente con una salmuera de hierbas, en alemán "Kräutersulz", según una receta del siglo pasado.

La cantidad de hierbas en la receta es guardada en estricto secreto.