Antonio de Carvajal había nacido en el año 1546, pero no consta dónde.

No se conoce el nombre de sus padres.

No contrajo matrimonio, pero tuvo dos hijas en Costa Rica con Francisca de Carvajal, hija al parecer de Diego Toroci de Carvajal, quien había sido rey del pueblo indígena de Ibuxibux, también llamado Pocris: doña Isabel, casada con don Miguel de Villalobos Jara, y doña Melchora, casada con Mateo Cornejo, encomendero de Teotique.

Posteriormente fue titular de una encomienda sobre los indígenas atirros, diaribas y yabiacas.

Ese mismo día salió hacía el río Grande de Tárcoles a recibir al nuevo gobernador interino, el adelantado Gonzalo Vázquez de Coronado y Arias Dávila, a quien pocos días después hizo entrega del mando.