[1]​ Cinco años más tarde, en 1930, viajó a Cuba en calidad de representante granadino en el Congreso Internacional de Universidades, que ese año se celebró en La Habana.

El rector depuesto fue sustituido por Salvador Vila quien, tras la denuncia interpuesta por Marín Ocete contra él y el resto de signatarios de la moción, fue detenido por falangistas y miembros de la Guardia Civil, que apoyaban a los militares golpistas, cuando se encontraba de vacaciones en Salamanca, y posteriormente fusilado sin juicio previo por los sublevados.

Entonces, dio comienzo a un largo mandato, que duró quince años, y en el que acometió la construcción del Colegio Mayor de Isabel la Católica y la nueva Facultad de Medicina, así como la remodelación del Real Colegio Mayor de San Bartolomé y Santiago y del Palacio de la Madraza.

Mantuvo sus cargos como catedrático de la Universidad y director del Conservatorio hasta su jubilación en 1970, falleciendo en Jun en 1972.

[1]​ En la actualidad, existen dos colegios de educación primaria con su nombre —uno en Granada y otro en Alfacar—; asimismo, tiene dedicada una calle en la capital granadina.