El 28 de enero de 1998 inicia un movimiento de consulta popular tras la cual renuncia a su militancia en el PRI y se consolida una coalición electoral denominada Alianza para el Cambio integrada por los partidos PAN, PRD, PT y PRS, que lo postula como candidato a gobernador.

El 4 de julio de 1999, obtiene un histórico triunfo en las elecciones que termina con la hegemonía del PRI en Nayarit.

Con un amplio respaldo popular a su administración gubernamental libera el transporte, multiplica la obra pública, moderniza el concepto de la asistencia social, da un impulso histórico a la educación y construye tres universidades tecnológicas.

Actualmente es presidente del Consejo de Administración del Grupo Empresarial Alica, concesionario en Nayarit de las marcas Coca-Cola, Volkswagen, Chrysler y Century 21 entre otras, además de diversas empresas locales.

En 2017, su hijo, Antonio Echevarría García fue Gobernador electo siendo candidato de una coalición conformada por los mismos partidos que lo postularon a él en 1999.