Nacido en Madrid, Amaya comenzó su carrera futbolística en San Cristóbal de los Ángeles.

San Sebastián de los Reyes, en Segunda División B se incorporaría al Rayo Vallecano en 2002, siendo cedido a su ex-club durante 6 meses.

Finalmente, Amaya que volvió, convirtiéndose en uno de los pilares en la defensa vallecana y capitán, ascendiendo a la Segunda División en 2007-08.

Vuelve cedido al club vallecano donde consigue el ascenso a la Primera División de España en junio del 2010.

Se trata, además, de un defensa con contrastada experiencia que suma un centenar de partidos oficiales en la máxima categoría del fútbol español, repartidos entre el cuadro madrileño y el Real Betis.