Anaxágoras dio también un gran impulso a la investigación de la naturaleza fundada en la experiencia, la memoria y la técnica.
Anaxágoras expuso su filosofía en su obra Peri physeos (Sobre la naturaleza), pero solo algunos fragmentos de sus libros han perdurado.
Más tarde Aristóteles llama a estas partículas con el nombre de homeomerías (partes semejantes).
El nous penetra algunas cosas y otras no, con lo que se explica, siguiendo a Anaxágoras, la existencia de objetos animados e inertes.
Las diferencias entre las concepciones de uno y otro pueden apreciarse con este ejemplo: para Anaxágoras los humanos pudieron hacerse inteligentes debido a que tenían manos, en cambio para Aristóteles el hombre recibió manos debido a que tenía inteligencia.