Dejó su carrera militar en 2003 tras haber sido seleccionado como candidato a astronauta de la Roscosmos.

Por el momento ha viajado en tres ocasiones a la Estación Espacial Internacional.

Ese mismo año intentó ingresar en la Escuela Superior de Pilotos de la Aviación Militar en Cherníhiv, pero no lo consiguió hasta el año siguiente que lo volvió a intentar.

[2]​ Esta misión era la Expedición 29 y viajó como ingeniero de vuelo n.º 2 junto a los astronautas Anton Shkaplerov y Daniel C.

Allí fueron recibidos por los miembros de la Expedición 28: Serguéi Vólkov, Satoshi Furukawa y Michael E. Fossum.

Durante la expedición, Ivanishin participó en 37 experimentos y estudios biomédicos científicos, entre los que se encontraban Bioemulsión, OChB, BIF, Kristallizator, Immuno, Aryl, Poligen, Identificación ”,“ Matryoshka-R ”y otros, llevaron a cabo trabajos para equipar la estación con equipos adicionales y mantener su eficiencia.