Aprovechando esta situación, el entonces presidente del PRD, Andrés Manuel López Obrador negoció una candidatura común con el PT y el PVEM para impulsar a Sánchez Anaya.

En el 2000, su esposa, María del Carmen Ramírez, fue candidata al Senado de la República, quien fue derrotada por la fórmula que integraron Joaquín Cisneros y Mariano González Zarur; pero logró el escaño por la vía de la Primera Minoría.

Así volvió a competir contra Mariano González Zarur del PRI-PVEM, pero esta vez ese partido sufrió una nueva ruptura con el entonces Presidente Municipal de Tlaxcala, Héctor Ortiz Ortiz, quien se convirtió en el candidato del PAN-PT-PCDT-PJS.

En 2015 Sánchez Anaya renunció a su militancia en el Partido de la Revolución Democrática y posteriormente se unió al Movimiento Regeneración Nacional, liderado por Andrés Manuel López Obrador.

Y compitió para diputado Federal por el I Distrito Electoral de Tlaxcala con cabecera en Apizaco representando al partido Morena pero esta vez no resultó elegido.