Su padre era un médico escocés de extracción neerlandesa que debió llegar a Turquía a principios del siglo XIX.
Además de su labor como docente, destacó por sus trabajos en arqueología sobre la Constantinopla bizantina.
Gracias a su dominio de distintas lenguas, entre las que se incluían el latín y el griego clásico, pudo recoger de primera mano los datos de las inscripciones en los monumentos bizantinos y realizar mediciones que reflejó en planos muy precisos de estos.
Publicó su trabajo en varios libros que siguen siendo de referencia en la materia.
Alexander Van Millingen 1840-1915, The families who lived in the Museum, Boğazıcı University Cultural Heritage Museum.