[2]​ Sufría enanismo (el único de entre sus hermanos),[2]​ debido a una displasia espondiloepifisaria congénita.

[3]​ Ya adulto, se trasladó a Leeuwarden, en el norte de Holanda, y se casó con Julia Sophie Elze, que también sufría de enanismo.

[2]​ Tuvieron un hijo, Alphons, nacido en 1930, que desarrolló una talla normal.

Aunque el doctor Mengele se ganaría más tarde una infausta reputación por sus experimentos médicos con enanos, todavía no había comenzado a trabajar en Auschwitz en el momento en el que Sophie fue enviada allí.

Los médicos integrantes del Instituto de Raza e Higiene del campo revisaban continuamente la masa de prisioneros para encontrar anormalidades que añadir a su colección patológica.

Le sometieron también a una serie de experimentos, sosteniendo que su corta estatura y su curvada columna vertebral eran la muestra de la degeneración judía.

[2]​ En 1994, Alphons Katan fue a Mauthausen para visitar el lugar en el que había muerto su padre, pero se horrorizó al ver expuestas las fotografías de su progenitor, en primer lugar despojado de la ropa, y finalmente de su propio cuerpo salvo los huesos.