Se desempeña como centrocampista y su actual equipo es el Atlético Ottawa de la Canadian Premier League.

Es el tercer jugador con más partidos oficiales disputados en la historia del Real Zaragoza.

En la temporada 2004/05 se ganó la titularidad y participó con el equipo maño en la Copa de la UEFA.

[6]​ Alberto Zapater se unió a César Navas del Rubin Kazán y a Marc Crosas del FC Volga como los tres únicos integrantes españoles de la Liga Premier de Rusia.

Durante los siguientes meses, llevaría a cabo un entrenamiento y recuperación individualizada de los citados problemas musculares con el recuperador físico del Real Zaragoza, Andrés Ubieto, y las lógicas especulaciones de que regresaría al club blanquillo definitivamente.

Participó en el Mundial sub-20 de 2005, en una selección sub-20 en la que se encontraban Cesc Fábregas, David Silva o Fernando Llorente, entre otros.