En su primer año en el equipo, disputó 27 partidos de liga, aunque jugó menos en la siguiente campaña.
En el 2005, Alan se unió al Porto FC, club en el no gozó de muchas oportunidades.
Luego de 2 años sombríos en el Dragón, el brasileño es cedido al Vitória Guimarães.
Durante la temporada 2007-2008, Alan es pieza clave en el Guimarães, pues disputa 2367 minutos y su aporte es fundamental para que el equipo consiga el tercer puesto en la liga tan solo un año después de haber logrado el ascenso.
Tras finalizar su periodo de cesión en el Vitória, Alan vuelve a la disciplina del Porto FC.