En 1569, Simón I confiscó Ajalgori a los duques de Ksani por traición, pero lo recuperaron pronto.

En esos años, el centro del ducado de Ksani se trasladó a Ajalgori desde Kvenipnevi.

[4]​ El nombre deriva de las palabras georgianas que significan "nuevo" y "colina" o "montaña".

[5]​ El viajero Jacob Reineggs, describiendo a Ajalgori, informa: “... esta pequeña ciudad, también [como Gori], está habitada por cristianos armenios, quienes, casi todos, se dedican al hilado de algodón y lino.

En la actualidad, la ciudad alberga otra fábrica de cerveza, la Vysokogornaya Kelskaya Pivovarnya, que abrió sus puertas en 2023.