El programa se centra en los agentes especiales del FBI Fox Mulder (David Duchovny) y Dana Scully (Gillian Anderson) que trabajan en casos vinculados a lo paranormal, llamados expedientes X. Mulder cree en lo paranormal, mientras que a la escéptica Scully se le ha asignado la tarea de desacreditar su trabajo.
La idea original del episodio presentaba a un monstruo suelto en una mina de oro abandonada.
Darren McGavin hace una segunda aparición como Arthur Dales después de ser presentado en «Travelers».
Después de sufrir un derrame cerebral, más tarde sería reemplazado por M. Emmet Walsh en «The Unnatural».
En Goodland, Florida, durante un feroz huracán, Sara Shipley y su hijo, Evan, intentan desesperadamente voltear una lavadora, pero no lo logran porque unos tentáculos los atrapan.
Scully tiene dudas sobre esto, pero cree que algo le sucedió a la familia Shipley durante este huracán.
Mulder y Scully luego encuentran el vehículo del oficial estacionado afuera de los apartamentos.
Mulder recorre el complejo para encontrar al resto de la gente y advertirles que la cosa está en las tuberías.
Sin embargo, el agua se acumula en la lámpara encima de ellos y aparece la criatura.
Mientras tanto, Mulder se da cuenta de que el agua dulce también es la clave y sale corriendo bajo la lluvia para curar sus heridas.
«Agua Mala», que fue escrito por David Amann (convirtiéndola en su segunda historia para The X-Files después de «Terms of Endearment»),[3] pasó por varios borradores muy diferentes.
[4] El título del episodio, «Agua Mala», es la traducción al español de las palabras en inglés bad water.
[6] «Aguamala» es también el nombre en jerga de la fragata portuguesa, una medusa venenosa similar en forma al antagonista principal del episodio.
Más tarde se buscó a McGavin para desempeñar el papel del padre de Mulder.
[9] McGavin también estaba programado para aparecer en el episodio escrito por Duchovny «The Unnatural», pero dos días después de comenzar la producción, sufrió un derrame cerebral, lo que obligó a los productores a eliminar sus escenas y reemplazarlas con otro «Arthur Dales», interpretado por M. Emmet Walsh.
Respecto a esto último, Bowman no filmó «nada para ese episodio durante el día, ni con nada más brillante que una linterna o una lámpara de emergencia en el pasillo»,[5] el director también explicó que «Agua Mala» fue difícil de filmar porque cuando un miembro del equipo o del elenco se mojaba demasiado, «tenían que detener todo para secarlos».
Michael Liedtke y George Avalos, en una reseña de la sexta temporada en The Charlotte Observer, calificaron el episodio como «simplemente malo».
Tom Kessenich, en su libro Examinations: An Unauthorized Look at Seasons 6–9 of the X-Files le dio al episodio una crítica mixta, escribiendo «en lo que respecta a [los monstruos de la semana], “Agua Mala” era una tarifa bastante estándar».