Nació en Londres en 1757 y fue hija de Andrew Thomson Esq.
En 1783 se casó en Bushey, Hertfordshire con James Ibbetson, hijo mayor del reverendo James Ibbetson D.D., rector y archidiácono de St.
Su marido James fue un abogado y anticuario aficionado al que el Lincoln's Inn admitió en 1771 y que falleció en 1790 a los 35 años, dejando viuda a Agnes.
Su sobrino fue Charles Poulett Thomson, un político que se convirtió en el primer gobernador de Canadá.
En el departamento de botánica del Museo Británico se preservan algunos especímenes del bosque y algunas placas microscópicas que preparó, con descripciones manuscritas que representan veinticuatro años de trabajo y ponen de manifiesto su creencia errónea de que los brotes se originan endógenamente y forzan su camino hacia afuera.