Aunque también perdió su escaño en la Asamblea de Quebec, Godbout se mantivo como líder del Partido Liberal, regresando al poder tras ganar las elecciones quebequesas de 1939.
Su Gobierno adoptó igualmente un nuevo Código Laboral que afirmaba específicamente el derecho de los trabajadores a la libertad sindical, y nacionalizó las compañías eléctricas en Montreal para crear Hydro-Québec, la institución pública que sería ampliamente extendida por René Lévesque y por el Gobierno de Jean Lesage durante la Révolution tranquille.
En 1949, Godbout fue nombrado senador de Canadá por recomendación del primer ministro canadiense Louis Saint-Laurent.
Sin embargo se le ha criticado su posición débil en temas autonómicos y en los aspectos del nacionalismo quebequés.
Otros historiadores, sin embargo, explican su actitud como motivada por las propias necesidades de la guerra.