Abubakar fue sucedido por Olusegun Obasanjo el 29 de mayo de 1999, el mismo día en que la constitución aprobada por Abubakar comenzó a ser válida en Nigeria.

En 1975 se desempeñó como oficial al mando, 84 batallón de infantería.

En 1982 fue nombrado coronel de administración y cuartel, primera división mecanizada.

Abubakar fue nombrado oficial general al mando de la primera división mecanizada 1990-1991.

En mayo de 1999, el general Abubakar entregó el poder al presidente civil recién elegido, Olusegun Obasanjo y se retiró del ejército.