En la RdRP, el subdominio de la palma comprende tres motivos bien conservados (A, B y C).
Esta interacción LL positiva se conoce como complementación intragénica e indica que la proteína L es un oligómero en el complejo de la ARN polimerasa viral.
La RdRp se activa en presencia de ARN bicatenario, sin embargo, esta función solo está presente en un subconjunto selecto de eucariotas, incluyendo Caenorhabditis elegans, Paramecium tetraurelia y plantas.
En Caenorhabditis elegans, Paramecium tetraurelia y plantas, los ARNip se integran en el complejo de silenciamiento inducido por ARN, RISC, que trabaja junto con los ARNm dirigidos a la interferencia para reclutar más RdRps para sintetizar más ARNip secundarios y reprimir la expresión génica.
Actualmente existen medicamentos antivirales contra la hepatitis C y la COVID-19 que se dirigen específicamente a la RdRP.
[10] El trifosfato GS-441524 es un sustrato para la RdRp, pero no polimerasas de mamíferos.
El trifosfato GS-441524 es la forma biológicamente activa del profármaco de fosfato remdesivir.
Según esta propuesta las RdRPs serían reliquias vivas del mundo de ARN al igual que las ribozimas, aunque las RdRP se derivarían de las ribozimas.
[2] Las RdRPs son estructuralmente similares a las transcriptasas inversas y las telomerasas, sin embargo las similitudes pueden ser una plesiomorfía por su carácter ancestral.
[19] En los tiempos precelulares se sugirió que las RdRPs precedieron a las transcriptasas inversas que serían las primeras enzimas en convertir el ARN en ADN dando origen últimamente a las restantes polimerasas como las ADN polimerasas.