El nuevo equipo comenzó a jugar en la Primera División Danesa (segunda categoría del país) debido a que el Horsens fS quedó quinto la pasada temporada.
Sin embargo, el club tuvo varios problemas en sus comienzos y llegó a pasar 2 temporadas en la Segunda División.
Finalmente lograría el ascenso en la temporada 2003-04, además de lograr llegar a las semifinales de la Copa de Dinamarca En su primer año en la SAS Ligaen el equipo se caracterizó por su juego defensivo, y logró mantener la categoría tras quedar en décimo lugar con una cifra récord en empates (13 en total).
En campañas posteriores los fichajes del equipo, y cambios en el esquema de juego, hicieron que el AC Horsens lograse su mejor puesto en 2008, con un quinto lugar.
Entre los artistas que han actuado ahí destacan Madonna, The Rolling Stones o REM entre otros.