Estas páginas, que no habían sido copiadas, fueron perdidas por el escriba de Smith, Martin Harris, durante el verano de 1828 y se presume que fueron destruidas.[7] Cuando Harris regresó, Lucy se negó a compartir su cama, y ella hizo que un pretendiente de su hija copiara subrepticiamente los caracteres en la Transcripción Anthon que Smith le había dado a Harris.[15] Después de negar su solicitud dos veces, Smith, con gran inquietud, dijo que el Señor había dado permiso, y permitió que Harris llevara las páginas del manuscrito a Palmyra con la condición de que se las mostrara a solo cinco miembros de la familia.Incluso hizo que Harris se atara a sí mismo en un juramento solemne.[17] En una ocasión, Harris abrió la cerradura de la oficina y la dañó, irritando a su esposa.A medida que lentamente ganaba fuerza, Smith la dejó al cuidado de su madre y regresó a Palmyra en busca de Harris y el manuscrito.[21] Al día siguiente, Harris fue arrastrado a la casa de la familia Smith en apuros y sin las páginas.[28] Según Smith, no volvió a traducir el material que Harris había perdido porque dijo que si lo hacía, los hombres malvados alterarían el manuscrito en un esfuerzo por desacreditarlo.[29] (Sin embargo, «los hombres malvados» también podrían haber alterado el manuscrito perdido para contradecir la nueva cuenta, como lo demuestra el supuesto deseo de Mark Hofmann de hacerlo).[30] Cuando Smith llegó al final del libro, le dijeron que Dios había previsto la pérdida del manuscrito temprano y había preparado la misma historia en un formato abreviado que enfatizaba la historia religiosa, las Planchas menores de Nefi.[31] Smith transcribió esta porción, y aparece como la primera parte del libro.