El ácido iboténico evoca efectos enteógenos en el ser humano a una dosis de 50-100 mg.

Estos efectos suelen durar en torno a 6-8 horas, variando según la dosis ingerida.

[5]​ El ácido iboténico es utilizado como agente de lesión cerebral en el entorno médico.

Cuando es inyectado intracranealmente, el ácido iboténico da lugar al desarrollo de lesiones excitotóxicas en el cerebro.

Este método de lesión cerebral experimental podría ser preferible en ciertas circunstancias porque, mientras se destruyen neuronas en un área del cerebro en particular, el tracto que atraviesa a través del núcleo no es dañado.