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Variante Iota del SARS-CoV-2

La variante Iota , [1] también conocida como linaje B.1.526 , es una de las variantes del SARS-CoV-2 , el virus que causa la COVID-19 . Se detectó por primera vez en la ciudad de Nueva York en noviembre de 2020. La variante ha aparecido con dos mutaciones notables: la mutación de la espícula E484K, que puede ayudar al virus a evadir los anticuerpos, y la mutación S477N, que ayuda al virus a unirse más fuertemente a las células humanas. [2]

En febrero de 2021, se había propagado rápidamente en la región de Nueva York y representaba aproximadamente una de cada cuatro secuencias virales. [3] [4] Para el 11 de abril de 2021, la variante se había detectado en al menos 48 estados de EE. UU. y 18 países. [5] [6]

Según el esquema de nombres simplificado propuesto por la Organización Mundial de la Salud , B.1.526 ha sido etiquetada como variante Iota y se considera una variante de interés (VOI), pero aún no una variante de preocupación . [7]

Mutaciones

El genoma de Iota (B.1.526) contiene las siguientes mutaciones de aminoácidos, todas ellas en el código de la proteína de pico del virus : L5F, T95I, D253G, E484K, D614G y A701V. [8]

Historia

El aumento de la variante Iota fue detectado por investigadores de Caltech mediante el escaneo de mutaciones en una base de datos conocida como GISAID , una iniciativa científica global que ha documentado más de 700.000 secuencias genómicas del SARS-CoV-2. [10] [11]

La proporción de casos en EE. UU. representados por la variante Iota había disminuido drásticamente a fines de julio de 2021, cuando la variante Delta se volvió dominante. [12]

Estadística

Véase también

Referencias

  1. ^ "Seguimiento de las variantes del SARS-CoV-2". www.who.int . Consultado el 1 de junio de 2021 .
  2. ^ Barton, Michael I; MacGowan, Stuart A; Kutuzov, Mikhail A; Dushek, Omer; Barton, Geoffrey John; van der Merwe, P Anton (26 de agosto de 2021). Fouchier, Ron AM; Van der Meer, Jos W; Fouchier, Ron AM (eds.). "Efectos de mutaciones comunes en el RBD de la proteína Spike del SARS-CoV-2 y su ligando, el receptor ACE2 humano, sobre la afinidad de unión y la cinética". eLife . 10 : e70658. doi : 10.7554/eLife.70658 . ISSN  2050-084X. PMC 8480977 . PMID  34435953. 
  3. ^ Rosa-Aquino, Matt Stieb, Paola (21 de marzo de 2021). "Todo lo que sabemos sobre la variante del coronavirus que se está propagando en la ciudad de Nueva York". Intelligencer . Consultado el 10 de abril de 2021 .{{cite web}}: CS1 maint: multiple names: authors list (link)
  4. ^ Mandavilli, Apoorva (24 de febrero de 2021). "Una nueva variante del coronavirus se está extendiendo en Nueva York, informan los investigadores". The New York Times . ISSN  0362-4331 . Consultado el 10 de abril de 2021 .
  5. ^ "outbreak.info". outbreak.info . Consultado el 10 de abril de 2021 .
  6. ^ "Linajes de PANGO Linaje B.1.526". cov-lineages.org . 22 de abril de 2021. Archivado desde el original el 22 de abril de 2021 . Consultado el 22 de abril de 2021 .
  7. ^ "Seguimiento de las variantes del SARS-CoV-2". www.who.int . Consultado el 1 de junio de 2021 .
  8. ^ "Clasificaciones y definiciones de variantes del SARS-CoV-2". CDC.gov . Centros para el Control y la Prevención de Enfermedades. 11 de febrero de 2020 . Consultado el 5 de julio de 2021 .
  9. ^ "Variantes de Spike: variante Iota, también conocida como B.1.526". covdb.stanford.edu . Base de datos de resistencia y antivirales del coronavirus de la Universidad de Stanford . 1 de julio de 2021 . Consultado el 5 de julio de 2021 .
  10. ^ Corum, Jonathan; Zimmer, Carl (9 de febrero de 2021). «Variantes y mutaciones del coronavirus». The New York Times . ISSN  0362-4331 . Consultado el 10 de abril de 2021 .
  11. ^ West, Anthony P.; Barnes, Christopher O.; Yang, Zhi; Bjorkman, Pamela J. (23 de febrero de 2021). "El linaje B.1.526 del SARS-CoV-2 emergente en la región de Nueva York detectado por una utilidad de software creada para consultar el panorama mutacional de la espiga". bioRxiv : 2021.02.14.431043. doi :10.1101/2021.02.14.431043. PMC 8077570 . PMID  33907745. S2CID  231981267. 
  12. ^ Secuencias del SARS-CoV-2 por variante, 26 de julio de 2021, EE. UU. Our World in Data
  13. ^ "GISAID - Variantes del virus hCov19". www.gisaid.org . Consultado el 2 de julio de 2021 .