Vía biológica

Serie de interacciones moleculares dentro de una célula que produce algún resultado.

Biología celular

En biología celular , una vía biológica es una serie de interacciones entre moléculas en una célula que conducen a un determinado producto o un cambio en la célula. Dicha vía puede desencadenar el ensamblaje de nuevas moléculas, como una grasa o una proteína . Las vías también pueden activar y desactivar genes , o estimular una célula para que se mueva. ^[1] Algunas de las vías biológicas más comunes están involucradas en el metabolismo , la regulación de la expresión genética y la transmisión de señales . Las vías desempeñan un papel clave en los estudios avanzados de genómica .

Tipos más comunes de vías biológicas: ^[1]

• Vía metabólica
• Vía genética
• Vía de transducción de señales

Neuroanatomía

En neuroanatomía, una vía neuronal es la conexión formada por axones que se proyectan desde las neuronas para hacer sinapsis con neuronas en otra ubicación, para permitir la neurotransmisión (el envío de una señal de una región del sistema nervioso a otra). ^[2]

Bases de datos de rutas

• La base de datos KEGG Pathway es una base de datos de búsqueda de vías muy popular y muy utilizada por los biólogos.
• WikiPathways es una base de datos de rutas seleccionada por la comunidad que utiliza el concepto "wiki". Todas las rutas tienen una licencia abierta y se pueden utilizar libremente.
• Reactome es una base de datos en línea gratuita y curada manualmente sobre vías biológicas.
• La base de datos de interacción de vías NCI-Nature Pathway es una base de datos biomédica gratuita de vías de señalización celular humana (nuevo nombre oficial: NCI Nature Pathway Interaction Database: Pathway, sinónimo: PID).
• PhosphoSitePlus es una base de datos de modificaciones postraduccionales observadas en proteínas humanas y de ratón; un recurso de biología de sistemas en línea que proporciona información integral y herramientas para el estudio de las modificaciones postraduccionales de proteínas (PTM), incluidas la fosforilación, la ubiquitinación, la acetilación y la metilación.
• La colección de bases de datos BioCyc es una variedad de bases de datos de vías/genomas específicos de organismos.
• La base de datos de referencia de proteínas humanas es una plataforma centralizada para representar visualmente e integrar información relativa a la arquitectura del dominio, las modificaciones postraduccionales, las redes de interacción y la asociación de enfermedades para cada proteína del proteoma humano (la última versión fue la número 9 en 2010).
• PANTHER (Protein ANalysis THrough Evolutionary Relationships) es una gran base de datos biológica curada de familias de genes/proteínas y sus subfamilias funcionalmente relacionadas que pueden usarse para clasificar e identificar la función de los productos genéticos.
• TRANSFAC (base de datos TRANScription FACtor) es una base de datos curada manualmente de factores de transcripción eucariotas, sus sitios de unión genómicos y perfiles de unión al ADN (proporcionados por geneXplain GmbH).
• MiRTarBase es una base de datos curada de interacciones microARN-objetivo.
• DrugBank es una base de datos en línea completa, de alta calidad y de libre acceso que contiene información sobre medicamentos y objetivos farmacológicos.
• esyN es un visualizador y constructor de redes que permite importar vías desde la base de datos de biomodelos o desde biogrid, flybase pombase y ver qué medicamentos interactúan con las proteínas en su red.
• La base de datos de toxicogenómica comparativa (CTD) es un sitio web público y una herramienta de investigación que conserva datos científicos que describen las relaciones entre sustancias químicas/fármacos, genes/proteínas, enfermedades, taxones, fenotipos, anotaciones GO, vías y módulos de interacción; CTD ilumina cómo las sustancias químicas ambientales afectan la salud humana.
• Pathway Commons es un proyecto y una base de datos que utiliza el lenguaje BioPAX para convertir, integrar y consultar otras bases de datos de interacciones y vías biológicas.

Véase también

• Proteostasis
• Metabolismo de la cisteína
• Análisis de vías

Fuentes

1. "Hoja informativa sobre vías biológicas".
2. Moore, Keith; Dalley, Arthur (2005). Anatomía con orientación clínica (5.ª ed.). LWW. pág. 47. ISBN 0-7817-3639-0Un haz de fibras nerviosas (axones) que conectan núcleos vecinos o distantes del SNC es un tracto.