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Sorbitol deshidrogenasa

La sorbitol deshidrogenasa (o SDH ) es una enzima citosólica . En humanos esta proteína está codificada por el gen SORD . [1]

La sorbitol deshidrogenasa es una enzima del metabolismo de los carbohidratos que convierte el sorbitol , la forma de alcohol de azúcar de la glucosa , en fructosa . [2] Junto con la aldosa reductasa , proporciona una forma para que el cuerpo produzca fructosa a partir de glucosa sin utilizar ATP . La sorbitol deshidrogenasa utiliza NAD + como cofactor; su reacción es sorbitol + NAD + → fructosa + NADH + H + . Un ion zinc también participa en la catálisis. Los órganos que lo utilizan con mayor frecuencia incluyen el hígado y la vesícula seminal ; se encuentra en varios organismos, desde bacterias hasta humanos . Un uso secundario es el metabolismo del sorbitol dietético , aunque se sabe que el sorbitol no se absorbe tan bien en el intestino como sus compuestos relacionados, la glucosa y la fructosa, y generalmente se encuentra en cantidades bastante pequeñas en la dieta (excepto cuando se usa como edulcorante artificial). ).

Estructura

La estructura de la sorbitol deshidrogenasa humana se determinó mediante experimentos de cristalización y difracción de rayos X (con una resolución de 2,20 Å). El método utilizado para la cristalización fue “Difusión de vapor, gota colgante” a pH 6,2 y a una temperatura de 295,0 K. La sorbitol deshidrogenasa consta de cuatro cadenas idénticas (A, B, C, D), cada una de las cuales es 31% helicoidal (14 hélices) y 26% de lámina beta (23 hebras). [3] El análisis MolProbity Ramachandran fue realizado por Lovell, Davis, et al. Los resultados fueron que el 97,1% de todos los residuos estaban en regiones favorecidas y el 100,0% de todos los residuos estaban en regiones permitidas, sin valores atípicos. [4] Las cuatro cadenas tienen 356 residuos cada una y un sitio catalítico. Los sitios catalíticos contienen un residuo de serina y de histidina, que son cadenas laterales hidrófilas. Los residuos requieren que NAD+ y un ion zinc estén presentes para la actividad catalítica. La sorbitol deshidrogenasa pertenece a la familia de las oxidorreductasas, lo que significa que ayuda a catalizar reacciones de oxidación-reducción. Como se indicó anteriormente, la enzima ayuda en la vía de conversión de glucosa en fructosa. [3]

Interacciones de subunidades en SDH

Las interacciones entre subunidades que forman un tetrámero en SDH están determinadas por interacción no covalente. [5] Estas interacciones no covalentes consisten en un efecto hidrofóbico, enlaces de hidrógeno e interacciones electrostáticas entre las cuatro subunidades idénticas. Para las proteínas homotetraméricas como la SDH, se cree que la estructura ha evolucionado pasando de una estructura monomérica a una dimérica y finalmente hacia una estructura tetramérica en la evolución. Las proteínas SDH tienen una estrecha relación evolutiva con la alcohol deshidrogenasa , que también pertenece a la superfamilia de proteínas de las enzimas deshidrogenasa/reductasa de cadena media (MDR). Las ADH de mamíferos son todas enzimas diméricas, pero ciertas ADH bacterianas también comparten una estructura cuaternaria tetramérica. La SDH de la mosca blanca de la hoja de plata y la de la levadura ADH1 carecen de un sitio estructural de zinc y comparten una estructura cuaternaria tetramérica, lo que muestra una estrecha relación evolutiva desde un punto de vista estructural entre las dos clases de proteínas (ADH y SDH). [5]

El proceso de unión general en SDH se describe por la ganancia de energía libre, que puede determinarse a partir de la tasa de asociación y disociación entre subunidades. [5]

Montaje de las cuatro subunidades (A,B,C y D) en SDH

Se ha demostrado que una red de enlaces de hidrógeno entre subunidades es importante para la estabilidad de la estructura de la proteína cuaternaria tetramérica. Por ejemplo, un estudio de SDH que utilizó diversos métodos, como alineamientos de secuencias de proteínas, comparaciones estructurales, cálculos de energía, experimentos de filtración en gel y experimentos de cinética enzimática, podría revelar una importante red de enlaces de hidrógeno que estabiliza la estructura cuaternaria tetramérica en la SDH de mamíferos. [5]

Significación clínica

En los tejidos donde la sorbitol deshidrogenasa es baja o está ausente, como en la retina, el cristalino, los riñones y las células nerviosas, el sorbitol puede acumularse en condiciones de hiperglucemia . En la diabetes no controlada, grandes cantidades de glucosa ingresan a estos tejidos y luego la aldosa reductasa la convierte en sorbitol. Luego, el sorbitol se acumula, lo que hace que el agua entre en la célula debido al aumento de la presión osmótica, lo que perjudica la función del tejido. La retinopatía , la formación de cataratas , la nefropatía y la neuropatía periférica que se observan en la diabetes se deben en parte a este fenómeno. [6]

Referencias

  1. ^ Iwata T, Popescu NC, Zimonjic DB, Karlsson C, Höög JO, Vaca G, Rodriguez IR, Carper D (marzo de 1995). "Organización estructural del gen de la sorbitol deshidrogenasa humana (SORD)". Genómica . 26 (1): 55–62. doi :10.1016/0888-7543(95)80082-W. PMID  7782086.
  2. ^ El-Kabbani O, Darmanin C, Chung RP (febrero de 2004). "Sorbitol deshidrogenasa: estructura, función y diseño de ligando". actual. Medicina. química . 11 (4): 465–76. doi :10.2174/0929867043455927. PMID  14965227.
  3. ^ ab PDB : 1pl7 ​; Pauly TA, Ekstrom JL, Beebe DA, Chrunyk B, Cunningham D, Griffor M, Kamath A, Lee SE, Madura R, Mcguire D, Subashi T, Wasilko D, Watts P, Mylari BL, Oates PJ, Adams PD, Rath VL (Septiembre de 2003). "Estudios cinéticos y cristalográficos de rayos X de la sorbitol deshidrogenasa humana". Estructura . 11 (9): 1071–85. doi : 10.1016/S0969-2126(03)00167-9 . PMID  12962626.
  4. ^ Lovell D, et al. (2003). "Trama de Ramachandran" (PDF) . Proteínas . 50 (3): 437–450. doi :10.1002/prot.10286. PMID  12557186. S2CID  8358424.
  5. ^ abcd Hellgren M, Kaiser C, de Haij S, Norberg A, Höög JO (2007). "Una red de enlaces de hidrógeno en la sorbitol deshidrogenasa de mamíferos estabiliza el estado tetramérico y es esencial para el poder catalítico". Celúla. Mol. Ciencias de la vida . 64 (23): 3129–3138. doi :10.1007/s00018-007-7318-1. PMC 11136444 . PMID  17952367. S2CID  22090973. 
  6. ^ Harvey, Richard; Ferrier, Denise (2011). Reseñas ilustradas de Lippincott: Quinta edición de bioquímica . Lippincott Williams y Wilkins. pag. 140.ISBN 9781608314126.
  1. ^ Beebe, Jane A.; Frey, Perry A. (1 de octubre de 1998). "Galactosa mutarotasa: purificación, caracterización e investigaciones de dos residuos importantes de histidina". Bioquímica . 37 (42): 14989–14997. doi :10.1021/bi9816047. ISSN  0006-2960.