Las ribonucleoproteínas nucleares heterogéneas ( hnRNP ) son complejos de ARN y proteína presentes en el núcleo celular durante la transcripción génica y la posterior modificación postranscripcional del ARN recién sintetizado (pre-ARNm). La presencia de las proteínas unidas a una molécula de pre-ARNm sirve como señal de que el pre-ARNm aún no está completamente procesado y, por lo tanto, no está listo para exportarse al citoplasma . [1] Dado que la mayor parte del ARN maduro se exporta desde el núcleo con relativa rapidez, la mayoría de las proteínas de unión al ARN en el núcleo existen como partículas de ribonucleoproteína heterogéneas. Después de que se ha producido el empalme, las proteínas permanecen unidas a los intrones empalmados y los dirigen a la degradación.
Las hnRNP también son parte integral de la subunidad 40S del ribosoma y, por lo tanto, son importantes para la traducción del ARNm en el citoplasma. [2] Sin embargo, las hnRNP también tienen sus propias secuencias de localización nuclear (NLS) y, por lo tanto, se encuentran principalmente en el núcleo. Aunque se sabe que algunas hnRNP se desplazan entre el citoplasma y el núcleo, la microscopía de inmunofluorescencia con anticuerpos específicos de hnRNP muestra la localización nucleoplásmica de estas proteínas con poca tinción en el nucléolo o el citoplasma. [3] Esto probablemente se deba a su papel principal en la unión a los ARN recién transcritos. La microscopía inmunoelectrónica de alta resolución ha demostrado que las hnRNP se localizan predominantemente en las regiones fronterizas de la cromatina , donde tienen acceso a estos ARN nacientes. [4]
Las proteínas implicadas en los complejos hnRNP se conocen colectivamente como ribonucleoproteínas heterogéneas. Incluyen la proteína K y la proteína de unión al tracto de polipirimidina (PTB), que está regulada por fosforilación catalizada por la proteína quinasa A y es responsable de suprimir el empalme de ARN en un exón particular al bloquear el acceso del espliceosoma al tracto de polipirimidina . [5] : 326 Las hnRNP también son responsables de fortalecer e inhibir los sitios de empalme al hacer que dichos sitios sean más o menos accesibles al espliceosoma. [6] Las interacciones cooperativas entre las hnRNP unidas pueden fomentar ciertas combinaciones de empalme mientras inhiben otras. [7]
Papel en el ciclo celular y el daño del ADN
Las hnRNP afectan varios aspectos del ciclo celular al reclutar, empalmar y co-regular ciertas proteínas de control del ciclo celular. Gran parte de la importancia de las hnRNP para el control del ciclo celular se evidencia por su papel como oncogén, en el que la pérdida de sus funciones da como resultado varios cánceres comunes. A menudo, la desregulación por parte de las hnRNP se debe a errores de empalme, pero algunas hnRNP también son responsables de reclutar y guiar a las proteínas mismas, en lugar de solo abordar los ARN nacientes.
BRCA1
La hnRNP C es un regulador clave de los genes BRCA1 y BRCA2 . En respuesta a la radiación ionizante, la hnRNP C se localiza parcialmente en el sitio del daño del ADN y, cuando se agota, se altera la progresión de la fase S de la célula. [8] Además, los niveles de BRCA1 y BRCA2 disminuyen cuando se pierde la hnRNP C. BRCA1 y BRCA2 son genes supresores de tumores cruciales que están fuertemente implicados en los cánceres de mama cuando están mutados. BRCA1 en particular causa la detención del ciclo celular G2/M en respuesta al daño del ADN a través de la cascada de señalización CHEK1 . [9] La hnRNP C es importante para la expresión adecuada de otros genes supresores de tumores, incluidos RAD51 y BRIP1. A través de estos genes, la hnRNP es necesaria para inducir la detención del ciclo celular en respuesta al daño del ADN por radiación ionizante . [7]
HER2
El HER2 se sobreexpresa en el 20-30% de los cánceres de mama y se asocia comúnmente con un mal pronóstico. Por lo tanto, se trata de un oncogén cuyas variantes empalmadas de manera diferente han demostrado tener diferentes funciones. Se ha demostrado que la eliminación de hnRNP H1 aumenta la cantidad de una variante oncogénica Δ16HER2. [10] HER2 es un regulador ascendente de la ciclina D1 y p27, y su sobreexpresión conduce a la desregulación del punto de control G1/S . [11]
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Las hnRNP también desempeñan un papel en la respuesta al daño del ADN en coordinación con p53 . La hnRNP K se induce rápidamente después del daño del ADN por radiación ionizante. Coopera con p53 para inducir la activación de los genes diana de p53, activando así los puntos de control del ciclo celular. [12] El propio p53 es un importante gen supresor de tumores a veces conocido con el epíteto de "el guardián del genoma". La estrecha asociación de hnRNP K con p53 demuestra su importancia en el control del daño del ADN.
p53 regula un gran grupo de ARN que no se traducen en proteínas, llamados ARN intergénicos grandes no codificantes ( lincRNA ). La supresión de genes por p53 a menudo se lleva a cabo por varios de estos lincRNA, que a su vez han demostrado actuar a través de hnRNP K. A través de interacciones físicas con estas moléculas, hnRNP K se dirige a los genes y transmite la regulación de p53, actuando así como un represor clave dentro de la vía transcripcional dependiente de p53. [13] [14]
Funciones
La hnRNP desempeña una variedad de procesos en la célula, algunos de los cuales incluyen:
Prevenir el plegamiento del pre-ARNm en estructuras secundarias que puedan inhibir sus interacciones con otras proteínas.
Posible asociación con el aparato de empalme.
Transporte de ARNm fuera del núcleo.
La asociación de una molécula de pre-ARNm con una partícula hnRNP evita la formación de estructuras secundarias cortas que dependen del apareamiento de bases de regiones complementarias, lo que hace que el pre-ARNm sea accesible para interacciones con otras proteínas.
Regulación CD44
Se ha demostrado que la hnRNP regula la CD44 , una glucoproteína de la superficie celular , a través de mecanismos de empalme. La CD44 está involucrada en las interacciones entre células y tiene papeles en la adhesión y migración celular. El empalme de la CD44 y las funciones de las isoformas resultantes son diferentes en las células de cáncer de mama, y cuando se inhibe, la hnRNP reduce tanto la viabilidad celular como la invasividad. [15]
Telómeros
Varias hnRNP interactúan con los telómeros , que protegen los extremos de los cromosomas del deterioro y a menudo se asocian con la longevidad celular. hnRNP D se asocia con la región de repetición rica en G de los telómeros, posiblemente estabilizando la región a partir de estructuras secundarias que inhibirían la replicación de los telómeros. [16]
También se ha demostrado que hnRNP interactúa con la telomerasa , la proteína responsable de alargar los telómeros y prevenir su degradación. Los hnRNP C1 y C2 se asocian con el componente ARN de la telomerasa, lo que mejora su capacidad para acceder al telómero. [17] [18] [19]
Ejemplos
Los genes humanos que codifican ribonucleoproteínas nucleares heterogéneas incluyen:
RNP mensajero : complejo entre el ARNm y la(s) proteína(s) presente(s) en el núcleo
Referencias
^ Kinniburgh, AJ; Martin, TE (1 de agosto de 1976). "Detección de secuencias de ARNm en subcomplejos nucleares de ribonucleoproteína 30S". Actas de la Academia Nacional de Ciencias . 73 (8): 2725–2729. Bibcode :1976PNAS...73.2725K. doi : 10.1073/pnas.73.8.2725 . ISSN 0027-8424. PMC 430721 . PMID 1066686.
^ Beyer, Ann L.; Christensen, Mark E.; Walker, Barbara W.; LeStourgeon, Wallace M. (1977). "Identificación y caracterización de las proteínas de empaquetamiento de partículas centrales 40S hnRNP". Cell . 11 (1): 127–138. doi :10.1016/0092-8674(77)90323-3. PMID 872217. S2CID 41245800.
^ Dreyfuss, Gideon; Matunis, Michael J.; Pinol-Roma, Serafin; Burd, Christopher G. (1 de junio de 1993). "Proteínas hnRNP y la biogénesis del ARNm". Revista Anual de Bioquímica . 62 (1): 289–321. doi :10.1146/annurev.bi.62.070193.001445. ISSN 0066-4154. PMID 8352591.
^ Fakan, S.; Leser, G.; Martin, TE (enero de 1984). "Distribución ultraestructural de ribonucleoproteínas nucleares visualizada mediante inmunocitoquímica en secciones delgadas". The Journal of Cell Biology . 98 (1): 358–363. doi :10.1083/jcb.98.1.358. ISSN 0021-9525. PMC 2113018 . PMID 6231300.
^ Matsudaira PT, Lodish HF, Berk A, Kaiser C, Krieger M, Scott MP, Bretscher A, Ploegh H (2008). Biología celular molecular . San Francisco: WH Freeman. ISBN978-0-7167-7601-7.
^ Matlin, Arianne J.; Clark, Francis; Smith, Christopher WJ (2005). "Entendiendo el splicing alternativo: hacia un código celular". Nature Reviews Molecular Cell Biology . 6 (5): 386–398. doi :10.1038/nrm1645. ISSN 1471-0080. PMID 15956978. S2CID 14883495.
^ ab Martínez-Contreras, Rebeca; Cloutier, Philippe; Shkreta, Lulzim; Fisette, Jean-François; Revil, Timothée; Chabot, Benoît (2007). "Proteínas HNRNP y control de empalme" . Empalme alternativo en la era posgenómica . Avances en Medicina y Biología Experimentales. vol. 623, págs. 123-147. doi :10.1007/978-0-387-77374-2_8. ISBN978-0-387-77373-5. ISSN 0065-2598. PMID 18380344.
^ Anantha, Rachel W.; Alcivar, Allen L.; Ma, Jianglin; Cai, Hong; Simhadri, Srilatha; Ule, Jernej; König, Julian; Xia, Bing (9 de abril de 2013). "Requisito de ribonucleoproteína C nuclear heterogénea para la expresión del gen BRCA y la recombinación homóloga". PLOS ONE . 8 (4): e61368. Bibcode :2013PLoSO...861368A. doi : 10.1371/journal.pone.0061368 . ISSN 1932-6203. PMC 3621867 . PMID 23585894.
^ Yoshida, Kiyotsugu; Miki, Yoshio (noviembre de 2004). "El papel de BRCA1 y BRCA2 como reguladores de la reparación del ADN, la transcripción y el ciclo celular en respuesta al daño del ADN". Cancer Science . 95 (11): 866–871. doi :10.1111/j.1349-7006.2004.tb02195.x. ISSN 1347-9032. PMC 11159131 . PMID 15546503. S2CID 24297965.
^ Gautrey, Hannah; Jackson, Claire; Dittrich, Anna-Lena; Browell, David; Lennard, Thomas; Tyson-Capper, Alison (3 de octubre de 2015). "SRSF3 y hnRNP H1 regulan un punto de corte y empalme de HER2 en células de cáncer de mama". RNA Biology . 12 (10): 1139–1151. doi :10.1080/15476286.2015.1076610. ISSN 1547-6286. PMC 4829299 . PMID 26367347.
^ Moasser, MM (2007). "El oncogén HER2: sus funciones de señalización y transformación y su papel en la patogénesis del cáncer humano". Oncogene . 26 (45): 6469–6487. doi :10.1038/sj.onc.1210477. ISSN 1476-5594. PMC 3021475 . PMID 17471238.
^ Moumen, Abdeladim; Masterson, Philip; O'Connor, Mark J.; Jackson, Stephen P. (2005). "hnRNP K: un objetivo de HDM2 y un coactivador transcripcional de p53 en respuesta al daño del ADN". Cell . 123 (6): 1065–1078. doi : 10.1016/j.cell.2005.09.032 . PMID 16360036. S2CID 16756766.
^ Huarte, Maite; Guttman, Mitchell; Feldser, David; Garber, Manuel; Koziol, Magdalena J.; Kenzelmann-Broz, Daniela; Khalil, Ahmad M.; Zuk, Or; Amit, Ido (2010). "Un ARN no codificante intergénico grande inducido por p53 media la represión génica global en la respuesta a p53". Cell . 142 (3): 409–419. doi :10.1016/j.cell.2010.06.040. PMC 2956184 . PMID 20673990.
^ Sun, Xinghui; Ali, Mohamed Sham Shihabudeen Haider; Moran, Matthew (1 de septiembre de 2017). "El papel de las interacciones de ARN largos no codificantes y ribonucleoproteínas nucleares heterogéneas en la regulación de las funciones celulares". Revista bioquímica . 474 (17): 2925–2935. doi :10.1042/bcj20170280. ISSN 0264-6021. PMC 5553131 . PMID 28801479.
^ Loh, Tiing Jen; Moon, Heegyum; Cho, Sunghee; Jang, Hana; Liu, Yong Chao; Tai, Hongmei; Jung, Da-Woon; Williams, Darren R.; Kim, Hey-Ran (septiembre de 2015). "El empalme alternativo de CD44 y la expresión de hnRNP A1 están asociados con la metástasis del cáncer de mama". Oncology Reports . 34 (3): 1231–1238. doi : 10.3892/or.2015.4110 . ISSN 1791-2431. PMID 26151392.
^ Eversole, A.; Maizels, N. (agosto de 2000). "Las propiedades in vitro de la proteína mamífera conservada hnRNP D sugieren un papel en el mantenimiento de los telómeros". Biología molecular y celular . 20 (15): 5425–5432. doi :10.1128/mcb.20.15.5425-5432.2000. ISSN 0270-7306. PMC 85994 . PMID 10891483.
^ Ford, LP; Suh, JM; Wright, WE; Shay, JW (diciembre de 2000). "Las ribonucleoproteínas nucleares heterogéneas C1 y C2 se asocian con el componente ARN de la telomerasa humana". Biología molecular y celular . 20 (23): 9084–9091. doi :10.1128/mcb.20.23.9084-9091.2000. ISSN 0270-7306. PMC 86561 . PMID 11074006.
^ Ford, Lance P.; Wright, Woodring E.; Shay, Jerry W. (21 de enero de 2002). "Un modelo para las ribonucleoproteínas nucleares heterogéneas en la regulación de los telómeros y la telomerasa". Oncogene . 21 (4): 580–583. doi :10.1038/sj.onc.1205086. ISSN 0950-9232. PMID 11850782.
^ Görlach, M.; Burd, CG; Dreyfuss, G. (16 de septiembre de 1994). "Los determinantes de la especificidad de unión al ARN de las proteínas heterogéneas de la ribonucleoproteína C nuclear". Revista de química biológica . 269 (37): 23074–23078. doi : 10.1016/S0021-9258(17)31621-6 . ISSN 0021-9258. PMID 8083209.
^ Dityatev, Alejandro; El-Husseini, Alaa (24 de noviembre de 2006). Mecanismos moleculares de sinaptogénesis. Saltador. ISBN9780387325620.
Lectura adicional
Xie J, Lee JA, Kress TL, Mowry KL, Black DL (julio de 2003). "La fosforilación de la proteína quinasa A modula el transporte de la proteína de unión al tracto de polipirimidina". Proc. Natl. Sci. USA . 100 (15): 8776–81. Bibcode :2003PNAS..100.8776X. doi : 10.1073/pnas.1432696100 . PMC 166389 . PMID 12851456.
Geuens T, Delphine B, Timmerman V (agosto de 2016). "La familia hnRNP: perspectivas sobre su papel en la salud y la enfermedad". Genética humana . 135 (8): 851–67. doi :10.1007/s00439-016-1683-5. PMC 4947485 . PMID 27215579.
Takimoto M, Tomonaga T, Matunis M, et al. (agosto de 1993). "Unión específica de la proteína K de la partícula de ribonucleoproteína heterogénea al promotor c-myc humano, in vitro". J. Biol. Chem . 268 (24): 18249–58. doi : 10.1016/S0021-9258(17)46837-2 . hdl : 2115/72478 . PMID: 8349701.
Watson, James D. (2004). Biología molecular del gen . San Francisco: Pearson/Benjamin Cummings. Págs. 9 y 10. ISBN.978-0-8053-4635-0.