ChemSpider es una base de datos en línea de libre acceso sobre productos químicos propiedad de la Royal Society of Chemistry . [3] [4] [5] [6] [7] Contiene información sobre más de 100 millones de moléculas de más de 270 fuentes de datos, cada una de las cuales recibe un identificador único llamado ChemSpider Identifier.
Las fuentes de la base de datos incluyen: [8]
La base de datos ChemSpider se puede actualizar con contribuciones de los usuarios, incluida la deposición de estructuras químicas , la deposición de espectros y la curación del usuario. Este es un enfoque de crowdsourcing para desarrollar una base de datos química en línea. La curación de datos basada en crowdsourcing ha producido un diccionario de nombres químicos asociados con estructuras químicas que se ha utilizado en aplicaciones de extracción de textos de la literatura biomédica y química. [10]
Sin embargo, no se renuncia a los derechos de la base de datos y no se dispone de un volcado de datos ; de hecho, las preguntas frecuentes incluso afirman que sólo se permiten descargas limitadas: [11] por lo tanto, el derecho a bifurcar no está garantizado y el proyecto no puede considerarse libre / abierto .
Se proporcionan varios módulos de búsqueda disponibles:
La base de datos ChemSpider se ha utilizado en combinación con la minería de texto como base para el marcado de documentos químicos . ChemMantis, [14] el sistema integrado de transformación de nomenclatura y marcado químico utiliza algoritmos para identificar y extraer nombres químicos de documentos y páginas web y convierte los nombres químicos en estructuras químicas utilizando algoritmos de conversión de nombre a estructura y búsquedas en diccionarios en ChemSpider. base de datos. El resultado es un sistema integrado entre documentos de química y búsqueda de información a través de ChemSpider en más de 150 fuentes de datos.
SyntheticPages es una base de datos interactiva gratuita de procedimientos de química sintética operada por la Royal Society of Chemistry . [15] Los usuarios envían procedimientos sintéticos que ellos mismos han realizado para su publicación en el sitio. Estos procedimientos pueden ser trabajos originales, pero más a menudo se basan en reacciones de la literatura. Cuando corresponde, se hacen citas del procedimiento original publicado. Son revisados por un editor científico antes de publicarlos. Las páginas no se someten a una revisión formal por pares como un artículo de revista científica , pero los usuarios que hayan iniciado sesión pueden realizar comentarios. Los comentarios también son moderados por editores científicos. La intención es recopilar experiencia práctica sobre cómo realizar síntesis químicas útiles en el laboratorio. Si bien los métodos experimentales publicados en una revista académica ordinaria se enumeran de manera formal y concisa, los procedimientos en ChemSpider SyntheticPages se brindan con más detalles prácticos. Se fomenta la informalidad. También se incluyen los comentarios de los remitentes. Otras publicaciones con cantidades comparables de detalles incluyen Síntesis Orgánicas y Síntesis Inorgánicas . El sitio SyntheticPages fue creado originalmente por los profesores Kevin Booker-Milburn ( Universidad de Bristol ), Stephen Caddick ( University College London ), Peter Scott ( Universidad de Warwick ) y Max Hammond. En febrero de 2010 se anunció una fusión [16] con el motor de búsqueda de estructuras químicas ChemSpider de la Royal Society of Chemistry y la formación de ChemSpider|SyntheticPages (CS|SP).
Varios servicios están disponibles en línea. Estos incluyen la conversión de nombres químicos en estructuras químicas , la generación de cadenas SMILES e InChI , así como la predicción de muchos parámetros fisicoquímicos y la integración a un servicio web que permite la predicción de RMN .
ChemSpider fue adquirido por la Royal Society of Chemistry (RSC) en mayo de 2009. [17] Antes de la adquisición por parte de RSC, ChemSpider estaba controlado por una corporación privada, ChemZoo Inc. El sistema se lanzó por primera vez en marzo de 2007 en una versión beta. forma y pasó a publicarse en marzo de 2008.
ChemSpider sirvió como depósito de compuestos químicos como parte del proyecto Open PHACTS , una iniciativa de medicamentos innovadores . Open PHACTS desarrollado según estándares abiertos, con un enfoque de web semántica de acceso abierto para abordar los obstáculos en el descubrimiento de fármacos de moléculas pequeñas: fuentes de información dispares, falta de estándares y sobrecarga de información. [18]