stringtranslate.com

Microcromosoma

Imagen de cromosomas de pollo en la que se muestran los numerosos microcromosomas (que aparecen como puntos). Las flechas indican un locus genético teñido en los macrocromosomas homólogos.

Un microcromosoma es un cromosoma definido por su tamaño relativamente pequeño. Son componentes típicos del cariotipo de las aves , algunos reptiles , peces , anfibios y monotremas . [1] Como muchos genomas de aves tienen cromosomas de longitudes muy diferentes, el nombre pretendía distinguirlos de los macrocromosomas comparativamente grandes . [2] La distinción se refería al tamaño medido del cromosoma durante la tinción para el cariotipo, y si bien no hay una definición estricta, los cromosomas que se asemejaban a los cromosomas grandes de los mamíferos se llamaban macrocromosomas (aproximadamente de 3 a 6 μm), mientras que los mucho más pequeños de menos de alrededor de 0,5 μm se llamaban microcromosomas . [3] En términos de pares de bases , por convención, los de menos de 20 Mb se llamaban microcromosomas , los de entre 20 y 40 Mb se clasifican como cromosomas intermedios y los de más de 40 Mb son macrocromosomas . [4] Según esta definición, todos los cromosomas normales en organismos con genomas relativamente pequeños (menos de 100-200 Mb) se considerarían microcromosomas.

Función

Los microcromosomas son característicamente muy pequeños y a menudo citogenéticamente indistinguibles en un cariotipo , lo que hace que ordenar e identificar cromosomas en un cariotipo coherente sea particularmente difícil. Si bien originalmente se pensó que eran fragmentos insignificantes de cromosomas, en las especies en las que se han estudiado se ha descubierto que son ricos en genes y tienen un alto contenido de GC . En los pollos , se ha estimado que los microcromosomas contienen entre el 50 y el 75% de todos los genes. [5] [6] Durante la metafase , aparecen simplemente como motas de 0,5 a 1,5 μm de largo. Su pequeño tamaño y su pobre condensación en heterocromatina significa que generalmente carecen de los patrones de bandas de diagnóstico y las ubicaciones distintivas del centrómero que se utilizan para la identificación de cromosomas. [7]

Aparición

Los microcromosomas se encuentran en muchos vertebrados, pero no en la mayoría de los mamíferos. [1] Se hicieron comparaciones importantes utilizando la organización genómica de la lanceta de Florida , parte de un grupo hermano de todos los vertebrados , lo que sugiere que el genoma ancestral de los amniotas (y de los vertebrados en general) consistía completamente en microcromosomas. La comparación entre los cromosomas de la lanceta y los de los vertebrados modernos muestra que los macrocromosomas fueron el resultado de la fusión entre microcromosomas ancestrales. Además, se muestra que la retención de microcromosomas es la norma ; la pérdida completa de ellos en los mamíferos es, en cambio, la excepción. [3]

En las aves

Los pollos tienen un número diploide de 78 cromosomas (2 n = 78) y, como es habitual en las aves, la mayoría son microcromosomas. La clasificación de los cromosomas de los pollos varía según el autor. Algunos los clasifican como 6 pares de macrocromosomas, un par de cromosomas sexuales y los 32 pares restantes son intermedios o microcromosomas. [5] Otras disposiciones, como la utilizada por el Consorcio Internacional de Secuenciación del Genoma del Pollo, incluyen cinco pares de macrocromosomas, cinco pares de cromosomas intermedios y veintiocho pares de microcromosomas. [4] [8] Los microcromosomas representan aproximadamente un tercio del tamaño total del genoma y se ha descubierto que tienen una densidad genética mucho mayor que los macrocromosomas. Debido a esto, se estima que la mayoría de los genes se encuentran en los microcromosomas, [6] aunque debido a la dificultad para identificar físicamente los microcromosomas y la falta de marcadores microsatélites , ha sido difícil ubicar genes en microcromosomas específicos. [8]

Las aves (excepto Falconidae ) suelen tener cariotipos de aproximadamente 80 cromosomas ( 2n = 80 ), de los cuales solo unos pocos son macrocromosomas distinguibles y un promedio de 60 son microcromosomas. [7] Son más abundantes en las aves que en cualquier otro grupo de animales. Los pollos ( Gallus gallus ) son un organismo modelo importante para estudiar los microcromosomas. [7] El examen de los microcromosomas en las aves ha llevado a la hipótesis de que pueden haberse originado como fragmentos conservados de macrocromosomas ancestrales y, a la inversa, que los macrocromosomas podrían haber surgido como agregados de microcromosomas. [7] El análisis genómico comparativo muestra que los microcromosomas contienen información genética que se ha conservado en múltiples clases de cromosomas. Esto indica que al menos diez microcromosomas de pollo surgieron de la fisión de cromosomas más grandes y que el cariotipo típico de las aves surgió hace 100-250 millones de años . [6]

Se ha descubierto que el tiempo de replicación y las tasas de recombinación difieren entre los micro y macrocromosomas en los pollos. Los microcromosomas se replican antes en la fase S de la interfase que los macrocromosomas. [5] También se ha descubierto que las tasas de recombinación son más altas en los microcromosomas. [9] Posiblemente debido a las altas tasas de recombinación, se ha descubierto que el cromosoma 16 del pollo (un microcromosoma) contiene la mayor diversidad genética de todos los cromosomas en ciertas razas de pollos . [9] Es probable que esto se deba a la presencia en este cromosoma del complejo mayor de histocompatibilidad (CMH).

En el caso de los numerosos grupos de ligamiento pequeños del genoma del pollo que no se han ubicado en los cromosomas, se ha supuesto que se encuentran en los microcromosomas. Algunos grupos de estos grupos se corresponden casi exactamente con grandes secciones de ciertos cromosomas humanos. Por ejemplo, los grupos de ligamiento E29C09W09, E21E31C25W12, E48C28W13W27, E41W17, E54 y E49C20W21 se corresponden con el cromosoma 7. [ 8]

Pavo

El pavo tiene un número diploide de 80 cromosomas (2 n = 80). El cariotipo contiene un par cromosómico adicional en relación con el pollo debido a la presencia de al menos dos diferencias de fisión/fusión (GGA2 = MGA3 y MGA6 y GGA4 = MGA4 y MGA9). Dadas estas diferencias que involucran a los macrocromosomas, también debe existir una fisión/fusión adicional entre las especies que involucra a los microcromosomas si los números diploides son válidos. Se han identificado otros reordenamientos a través de mapas genéticos comparativos [10] , mapas físicos y secuenciación del genoma completo [11] .

En las tortugas

Los microcromosomas juegan un papel clave en la determinación del sexo en las tortugas de caparazón blando . [12]

En humanos y otros animales

Los microcromosomas están ausentes en los cariotipos de los mamíferos [3] y algunos anfibios [13] (el ornitorrinco monotrema tiene un cariotipo intermedio con cromosomas más pequeños que no son del todo "micro"). [3]

En casos raros, se han observado microcromosomas en los cariotipos de individuos humanos. Se ha sugerido un vínculo entre la presencia de microcromosomas y ciertos trastornos genéticos como el síndrome de Down [14] y el síndrome del cromosoma X frágil . [15] El cromosoma más pequeño en humanos normalmente es el cromosoma 21 , que tiene 47 Mb.

Véase también

Referencias

  1. ^ ab Ohno, Susumu; Christian, LC; Stenius, Christina (septiembre de 1962). "Microcromosomas organizadores del nucléolo de Gallus domesticus". Investigación celular experimental . 27 (3): 612–614. doi :10.1016/0014-4827(62)90033-2. PMID  13939683.
  2. ^ Hillier, LaDeana W.; Consorcio Internacional de Secuenciación del Genoma del Pollo (diciembre de 2004). "El análisis comparativo y secuencial del genoma del pollo proporciona perspectivas únicas sobre la evolución de los vertebrados". Nature . 432 (7018): 695–716. Bibcode :2004Natur.432..695C. doi : 10.1038/nature03154 . PMID  15592404.
  3. ^ abcd Waters, Paul D.; Patel, Hardip R.; Ruiz-Herrera, Aurora; Álvarez-González, Lucía; Lister, Nicholas C.; Simakov, Oleg; Ezaz, Tariq; Kaur, Parwinder ; Frere, Celine; Grützner, Frank; Georges, Arthur; Graves, Jennifer A. Marshall (9 de noviembre de 2021). «Los microcromosomas son los componentes básicos de los cromosomas de aves, reptiles y mamíferos». Actas de la Academia Nacional de Ciencias . 118 (45): e2112494118. Bibcode :2021PNAS..11812494W. doi : 10.1073/pnas.2112494118 . PMC 8609325 . PMID  34725164. 
  4. ^ ab Axelsson, Erik; Webster, Matthew T.; Smith, Nick GC; Burt, David W.; Ellegren, Hans (2005). "La comparación de los genomas de pollo y pavo revela una mayor tasa de divergencia de nucleótidos en los microcromosomas que en los macrocromosomas". Genome Research . 15 (1): 120–5. doi :10.1101/gr.3021305. PMC 540272 . PMID  15590944. 
  5. ^ abc McQueen, Heather A.; Siriaco, Giorgia; Bird, Adrian P. (1998). "Los microcromosomas de pollo están hiperacetilados, se replican temprano y son ricos en genes". Genome Research . 8 (6): 621–30. doi :10.1101/gr.8.6.621. PMC 310741 . PMID  9647637. 
  6. ^ abc Burt, DW (2002). "Origen y evolución de los microcromosomas aviares". Cytogenetic and Genome Research . 96 (1–4): 97–112. doi :10.1159/000063018. PMID  12438785. S2CID  26017998.
  7. ^ abcd Fillon, Valérie (1998). "El pollo como modelo para estudiar los microcromosomas en las aves: una revisión". Genética Selección Evolución . 30 (3): 209–19. doi : 10.1186/1297-9686-30-3-209 . PMC 2707402 . 
  8. ^ abc Groenen, Martien AM; Cheng, Hans H.; Bumstead, Nat; Benke, Bernard F.; Briles, W. Elwood; Burke, Terry; Burt, Dave W.; Crittenden, Lyman B.; et al. (2000). "Un mapa de ligamiento de consenso del genoma del pollo". Genome Research . 10 (1): 137–47. doi :10.1101/gr.10.1.137 (inactivo el 1 de noviembre de 2024). PMC 310508 . PMID  10645958. {{cite journal}}: CS1 maint: DOI inactivo a partir de noviembre de 2024 ( enlace )
  9. ^ ab Ka-Shu Wong, Gane; Liu, Bin; Wang, junio; Zhang, Yong; Yang, Xu; Zhang, Zengjin; Meng, Qingshun; Zhou, junio; et al. (2004). "Un mapa de variación genética para pollos con 2,8 millones de polimorfismos de un solo nucleótido". Naturaleza . 432 (7018): 717–22. Código Bib :2004Natur.432..717B. doi : 10.1038/naturaleza03156. PMC 2263125 . PMID  15592405. 
  10. ^ Reed, KM; Chaves, LD; Mendoza, KM (2007). "Un mapa genético integrado y comparativo del genoma del pavo". Cytogenetic and Genome Research . 119 (1–2): 113–26. doi :10.1159/000109627. PMID  18160790. S2CID  42494634.
  11. ^ Roberts, Richard J.; Dalloul, Rami A.; Long, Julie A.; Zimin, Aleksey V.; Aslam, Luqman; Beal, Kathryn; Ann Blomberg, Le; Bouffard, Pascal; et al. (2010). "Secuenciación multiplataforma de próxima generación del pavo doméstico (Meleagris gallopavo): ensamblaje y análisis del genoma". PLOS Biology . 8 (9): e1000475. doi : 10.1371/journal.pbio.1000475 . PMC 2935454 . PMID  20838655. 
  12. ^ Badenhorst, Daleen; Stanyon, Roscoe; Engstrom, Tag; Valenzuela, Nicole (20 de marzo de 2013). "Un sistema de microcromosomas ZZ/ZW en la tortuga de caparazón blando espinosa, Apalone spinifera, revela una intrigante conservación de los cromosomas sexuales en Trionychidae". Investigación cromosómica . 21 (2): 137–147. doi :10.1007/s10577-013-9343-2. ​​ISSN  0967-3849. PMID  23512312. S2CID  14434440.
  13. ^ Zlotina, A; Dedukh, D; Krasikova, A (8 de noviembre de 2017). "Evolución del cariotipo de anfibios y aves: perspectivas a partir de estudios cromosómicos en Lampbrush". Genes . 8 (11): 311. doi : 10.3390/genes8110311 . PMC 5704224 . PMID  29117127. 
  14. ^ Ramos, C; Rivera, L; Benítez, J; Tejedor, E; Sanchez-Cascos, A (1979). "Recurrencia del síndrome de Down asociada a microcromosomas". Genética Humana . 49 (1): 7–10. doi :10.1007/BF00277682. PMID  157321. S2CID  6251717.
  15. ^ López-Pajares, I.; Delicado, A.; Pascual-Castroviejo, I.; López-Martín, V.; Moreno, F.; García-Marcos, JA (1994). "Síndrome X frágil con microcromosoma extra". Genética Clínica . 45 (4): 186–9. doi :10.1111/j.1399-0004.1994.tb04020.x. PMID  8062436. S2CID  35421842.