La coenzima Q: citocromo c – oxidorreductasa , a veces llamada complejo citocromo bc 1 , y en otras ocasiones complejo III , es el tercer complejo en la cadena de transporte de electrones ( EC 1.10.2.2), desempeñando un papel crítico en la generación bioquímica de ATP ( fosforilación oxidativa ). El complejo III es una proteína transmembrana multisubunidad codificada tanto por el genoma mitocondrial ( citocromo b ) como por el nuclear (todas las demás subunidades). El complejo III está presente en las mitocondrias de todos los animales y todos los eucariotas aeróbicos y en las membranas internas de la mayoría de las bacterias . Las mutaciones en el complejo III causan intolerancia al ejercicio, así como trastornos multisistémicos. El complejo bc1 contiene 11 subunidades, 3 subunidades respiratorias (citocromo B, citocromo C1, proteína de Rieske), 2 proteínas centrales y 6 proteínas de bajo peso molecular .
Ubiquinol: la citocromo-c reductasa cataliza la reacción química
QH 2 + 2 ferricitocromo c Q + 2 ferrocitocromo c + 2 H +
Así, los dos sustratos de esta enzima son quinol (QH 2 ) y ferri- (Fe 3+ ) citocromo c , mientras que sus 3 productos son quinona (Q), ferro- (Fe 2+ ) citocromo c y H + .
El nombre sistemático de esta clase de enzimas es ubiquinol:ferricitocromo-c oxidorreductasa . Otros nombres de uso común son:
Estructura
En comparación con las otras subunidades principales de bombeo de protones de la cadena de transporte de electrones , el número de subunidades encontradas puede ser pequeño, tan pequeño como tres cadenas polipeptídicas. Este número aumenta, y se encuentran once subunidades en animales superiores. [2] Tres subunidades tienen grupos prostéticos . La subunidad del citocromo b tiene dos hemo de tipo b ( b L y b H ), la subunidad del citocromo c tiene un hemo de tipo c ( c 1 ) y la subunidad de proteína de azufre de hierro de Rieske (ISP) tiene un grupo de hierro-azufre de dos hierros y dos azufres (2Fe•2S).
En los vertebrados, el complejo bc 1 , o complejo III, contiene 11 subunidades: 3 subunidades respiratorias, 2 proteínas centrales y 6 proteínas de bajo peso molecular. [3] [4] Los complejos proteobacterianos pueden contener tan solo tres subunidades. [5]
Tabla de composición de subunidades del complejo III
a En los vertebrados, un producto de escisión de 8 kDa del extremo N de la proteína Rieske ( péptido señal ) se retiene en el complejo como subunidad 9. Por tanto, las subunidades 10 y 11 corresponden a QCR9p y QCR10p fúngicos.
Reacción
Cataliza la reducción del citocromo c por oxidación de la coenzima Q (CoQ) y el bombeo concomitante de 4 protones desde la matriz mitocondrial al espacio intermembrana:
QH 2 + 2 citocromo c (Fe III ) + 2 H+ en→ Q + 2 citocromo c (Fe II ) + 4 H+ fuera
En el proceso llamado ciclo Q , [6] [7] se consumen dos protones de la matriz (M), se liberan cuatro protones al espacio intermembrana (IM) y dos electrones pasan al citocromo c .
Mecanismo de reacción
El mecanismo de reacción del complejo III (citocromo bc1, coenzima Q: citocromo C oxidorreductasa) se conoce como ciclo de la ubiquinona ("Q"). En este ciclo se liberan cuatro protones en el lado positivo "P" (espacio intermembrana), pero solo se absorben dos protones del lado negativo "N" (matriz). Como resultado, se forma un gradiente de protones a través de la membrana. En la reacción general, dos ubiquinoles se oxidan a ubiquinonas y una ubiquinona se reduce a ubiquinol . En el mecanismo completo, se transfieren dos electrones del ubiquinol a la ubiquinona, a través de dos intermediarios del citocromo c.
En general :
2 x QH 2 oxidado a Q
1 x Q reducido a QH 2
2 x Cyt c reducido
4 x H + liberados al espacio intermembrana
2 x H + extraídos de la matriz
La reacción se desarrolla según los siguientes pasos:
Ronda 1 :
El citocromo b une un ubiquinol y una ubiquinona.
El centro 2Fe/2S y el hemo B L extraen cada uno un electrón del ubiquinol unido, liberando dos protones en el espacio intermembrana.
Un electrón se transfiere al citocromo c 1 desde el centro 2Fe/2S, mientras que otro se transfiere del hemo B L al hemo B H.
El citocromo c 1 transfiere su electrón al citocromo c (que no debe confundirse con el citocromo c1), y el hemo B H transfiere su electrón a una ubiquinona cercana, lo que da como resultado la formación de una ubisemiquinona.
El citocromo c se difunde. El primer ubiquinol (ahora oxidado a ubiquinona) se libera, mientras que la semiquinona permanece unida.
Ronda 2 :
Un segundo ubiquinol está unido al citocromo b.
El centro 2Fe/2S y el hemo B L extraen cada uno un electrón del ubiquinol unido, liberando dos protones en el espacio intermembrana.
Un electrón se transfiere al citocromo c 1 desde el centro 2Fe/2S, mientras que otro se transfiere del hemo B L al hemo B H.
Luego, el citocromo c 1 transfiere su electrón al citocromo c , mientras que la semiquinona cercana producida en la ronda 1 recoge un segundo electrón del hemo B H , junto con dos protones de la matriz.
El segundo ubiquinol (ahora oxidado a ubiquinona), junto con el ubiquinol recién formado, se liberan. [8]
Inhibidores del complejo III
Hay tres grupos distintos de inhibidores del complejo III.
La antimicina A se une al sitio Qi e inhibe la transferencia de electrones en el Complejo III desde el hemo b H hasta Q oxidado (inhibidor del sitio Qi).
El mixotiazol y la estigmatelina se unen al sitio Q o e inhiben la transferencia de electrones desde el QH 2 reducido a la proteína de azufre de hierro de Rieske. El mixotiazol y la estigmatelina se unen a bolsillos distintos pero superpuestos dentro del sitio Q o .
El mixotiazol se une más cerca del citocromo bL (por lo que se le denomina inhibidor " proximal ").
La estigmatelina se une más lejos del hemo bL y más cerca de la proteína de azufre de hierro de Rieske, con la que interactúa fuertemente.
Una pequeña fracción de electrones abandona la cadena de transporte de electrones antes de alcanzar el complejo IV . La fuga prematura de electrones al oxígeno da como resultado la formación de superóxido . La relevancia de esta reacción secundaria, por lo demás menor, es que el superóxido y otras especies reactivas del oxígeno son altamente tóxicas y se cree que desempeñan un papel en varias patologías, así como en el envejecimiento (la teoría de los radicales libres del envejecimiento ). [10] La fuga de electrones se produce principalmente en el sitio Q o y es estimulada por la antimicina A. La antimicina A bloquea los b -hemes en el estado reducido al evitar su reoxidación en el sitio Q i , lo que, a su vez, hace que aumenten las concentraciones en estado estacionario de la semiquinona Q o , y esta última especie reacciona con el oxígeno para formar superóxido . Se cree que el efecto del alto potencial de membrana tiene un efecto similar. [11] El superóxido producido en el sitio Qo puede liberarse tanto en la matriz mitocondrial [12] [13] como en el espacio intermembrana, donde luego puede alcanzar el citosol. [12] [14] Esto podría explicarse por el hecho de que el Complejo III podría producir superóxido como HOO permeable a la membrana en lugar de como O impermeable a la membrana .-. 2. [13]
Nombres de genes humanos
MT-CYB : citocromo b codificado por mtADN ; mutaciones asociadas con intolerancia al ejercicio
TTC19 : subunidad recientemente identificada, mutaciones vinculadas a la deficiencia nuclear del complejo III tipo 2. Ayuda a eliminar el fragmento N-terminal de UQCRFS1, que de otro modo interferiría con la función del complejo III. [15]
Mutaciones en genes del complejo III en enfermedades humanas
Las mutaciones en genes relacionados con el complejo III se manifiestan típicamente como intolerancia al ejercicio. [16] [17] Se ha informado que otras mutaciones causan displasia septoóptica [18] y trastornos multisistémicos. [19] Sin embargo, las mutaciones en BCS1L , un gen responsable de la maduración adecuada del complejo III, pueden dar lugar al síndrome de Björnstad y al síndrome GRACILE , que en los neonatos son afecciones letales que tienen manifestaciones multisistémicas y neurológicas que caracterizan a trastornos mitocondriales graves. La patogenicidad de varias mutaciones se ha verificado en sistemas modelo como la levadura. [20]
Se desconoce actualmente en qué medida estas diversas patologías se deben a déficits bioenergéticos o a una sobreproducción de superóxido .
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Lectura adicional
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Enlaces externos
Sitio del complejo citocromo bc1 (Edward A. Berry) en Wayback Machine (archivado el 9 de octubre de 2006) en lbl.gov
Sitio del complejo citocromo bc1 (Antony R. Crofts) Archivado el 17 de septiembre de 2007 en Wayback Machine en uiuc.edu
Base de datos PROMISE: complejo citocromo bc1 en archive.today (archivado el 27 de agosto de 1999) en scripps.edu
Modelo molecular interactivo del complejo III en Wayback Machine (archivado el 12 de enero de 2009) (requiere MDL Chime)