stringtranslate.com

Piwi

El dominio piwi de una proteína argonauta con ARNi unido , componentes del complejo de silenciamiento inducido por ARN que media el silenciamiento genético por interferencia de ARN .
Todas las proteínas Piwi humanas y las proteínas argonautas tienen los mismos dominios de unión de ARN, PAZ y Piwi. [2]
Interacciones Piwi-piRNA: Dentro del núcleo, esta vía está involucrada en la metilación del ADN (A), la metilación de histonas de H3K9 a través de interacciones con la proteína heterocromatina 1 (HP1) y la histona metiltransferasa H3K9 (B). La vía Piwi-piRNA también interactúa con el iniciador de la traducción elF (C). [3]

Los genes Piwi (o PIWI ) fueron identificados como proteínas reguladoras responsables de la diferenciación de células madre y células germinales . [4] Piwi es una abreviatura de P -element I nduced WI mpy testis [a] en Drosophila . [6] Las proteínas Piwi son proteínas de unión al ARN altamente conservadas y están presentes tanto en plantas como en animales. [7] Las proteínas Piwi pertenecen a la familia Argonaute/Piwi y han sido clasificadas como proteínas nucleares. Los estudios en Drosophila también han indicado que las proteínas Piwi no tienen actividad de corte conferida por la presencia del dominio Piwi. [8] Además, Piwi se asocia con la proteína heterocromatina 1 , un modificador epigenético, y secuencias complementarias de piRNA. Estos son indicios del papel que juega Piwi en la regulación epigenética. También se cree que las proteínas Piwi controlan la biogénesis de piRNA ya que muchas proteínas similares a Piwi contienen actividad de corte que permitiría a las proteínas Piwi procesar el piRNA precursor en piRNA maduro.

Estructura y función de las proteínas

Se ha resuelto la estructura de varias proteínas Piwi y Argonaute (Ago). Las proteínas Piwi son proteínas de unión al ARN con 2 o 3 dominios : el dominio PAZ N-terminal se une al extremo 3' del ARN guía; el dominio MID medio se une al fosfato 5' del ARN; y el dominio PIWI C-terminal actúa como una endonucleasa ARNasa H que puede escindir el ARN. [9] [10] Los pequeños ARN asociados a las proteínas Ago son microARN (miARN). Las proteínas Ago utilizan miARN para silenciar genes postranscripcionalmente o utilizan ARN interferentes pequeños (siARN) tanto en mecanismos de silenciamiento de transcripción como postranscripcional. Las proteínas Piwi interactúan con piARN (28-33 nucleótidos) que son más largos que los miARN y siARN (~20 nucleótidos), lo que sugiere que sus funciones son distintas a las de las proteínas Ago. [9]

Proteínas humanas Piwi

Actualmente se conocen cuatro proteínas humanas Piwi: proteína similar a PIWI 1, proteína similar a PIWI 2, proteína similar a PIWI 3 y proteína similar a PIWI 4. Todas las proteínas humanas Piwi contienen dos dominios de unión al ARN, PAZ y Piwi. Las cuatro proteínas similares a PIWI tienen un sitio de unión espacioso dentro del dominio PAZ que les permite unirse al voluminoso 2'-OCH3 en el extremo 3' del ARN que interactúa con piwi . [11]

Uno de los principales homólogos humanos , cuya regulación positiva está implicada en la formación de tumores como los seminomas , se llama hiwi ( por p iwi humano ). [12]

Las proteínas homólogas en ratones se han denominado miwi (por ratón piwi ). [ 13]

Papel en las células de la línea germinal

Las proteínas PIWI desempeñan un papel crucial en la fertilidad y el desarrollo de la línea germinal en animales y ciliados. Recientemente identificadas como un componente de gránulo polar, las proteínas PIWI parecen controlar la formación de células germinales tanto que en ausencia de proteínas PIWI hay una disminución significativa en la formación de células germinales. Se hicieron observaciones similares con los homólogos de ratón de PIWI, MILI, MIWI y MIWI2. Se sabe que estos homólogos están presentes en la espermatogénesis. Miwi se expresa en varias etapas de formación de espermatocitos y elongación de espermátidas, donde Miwi2 se expresa en células de Sertoli . Los ratones deficientes en Mili o Miwi-2 han experimentado un arresto de células madre espermatogénicas y aquellos que carecen de Miwi-2 experimentaron una degradación de las espermatogonias. [14] Los efectos de las proteínas piwi en las líneas germinales humanas y de ratón parecen provenir de su participación en el control de la traducción, ya que se sabe que Piwi y el ARN pequeño no codificante, el ARN que interactúa con piwi (piRNA), cofraccionan polisomas. La vía piwi-piRNA también induce la formación de heterocromatina en los centrómeros , [15] afectando así la transcripción. La vía piwi-piRNA también parece proteger el genoma. Observadas por primera vez en Drosophila, las vías piwi-piRNA mutantes llevaron a un aumento directo en las roturas de dsADN en las células germinales ováricas. El papel de la vía piwi-piRNA en el silenciamiento de transposones puede ser responsable de la reducción de las roturas de dsADN en las células germinales.

Papel en la interferencia del ARN

El dominio piwi [16] es un dominio proteico que se encuentra en las proteínas piwi y en una gran cantidad de proteínas relacionadas que se unen a ácidos nucleicos , especialmente las que se unen y escinden el ARN . La función del dominio es la hidrólisis guiada por ARN bicatenario del ARN monocatenario que se ha determinado en la familia argonauta de proteínas relacionadas. [1] Los argonautas, la familia de proteínas de unión a ácidos nucleicos mejor estudiada, son enzimas similares a la ARNasa H que llevan a cabo las funciones catalíticas del complejo de silenciamiento inducido por ARN (RISC). En el conocido proceso celular de interferencia de ARN , la proteína argonauta en el complejo RISC puede unirse tanto al ARN interferente pequeño (siRNA) generado a partir de ARN bicatenario exógeno como al microARN (miRNA) generado a partir de ARN no codificante endógeno , ambos producidos por la ribonucleasa Dicer , para formar un complejo ARN-RISC. Este complejo se une y corta el ARN mensajero de pares de bases complementarios , destruyéndolo y evitando su traducción a proteína. Los dominios piwi cristalizados tienen un sitio de unión básico conservado para el extremo 5' del ARN unido; en el caso de las proteínas argonautas que se unen a cadenas de ARNi, la última base de nucleótido no apareada del ARNi también se estabiliza mediante interacciones de apilamiento de bases entre la base y los residuos de tirosina vecinos . [17]

Evidencias recientes sugieren que el papel funcional de las proteínas piwi en la determinación de la línea germinal se debe a su capacidad de interactuar con los microARN. Los componentes de la vía de los microARN parecen estar presentes en el plasma polar y desempeñar un papel clave en el desarrollo temprano y la morfogénesis de los embriones de Drosophila melanogaster , en los que se ha estudiado ampliamente el mantenimiento de la línea germinal. [18]

PiRNA y silenciamiento de transposones

Se ha definido una nueva clase de miRNA más largos que el promedio conocidos como ARN que interactúan con Piwi (piRNA) en células de mamíferos , de alrededor de 26-31 nucleótidos de longitud en comparación con el miRNA o siRNA más típico de alrededor de 21 nucleótidos. Estos piRNA se expresan principalmente en células espermatogénicas en los testículos de mamíferos. [19] Pero los estudios han informado que la expresión de piRNA se puede encontrar en las células somáticas ováricas y las células neuronales en invertebrados, así como en muchas otras células somáticas de mamíferos. Se han identificado piRNA en los genomas de ratones , ratas y humanos , con una organización genómica "agrupada" inusual [20] que puede originarse a partir de regiones repetitivas del genoma como retrotransposones o regiones normalmente organizadas en heterocromatina , y que normalmente se derivan exclusivamente de la cadena antisentido de ARN bicatenario. [21] Por lo tanto, los piRNA se han clasificado como pequeños ARN interferentes asociados a repeticiones ( rasiRNA ). [22]

Aunque su biogénesis aún no se entiende bien, se cree que los piRNA y las proteínas Piwi forman un sistema endógeno para silenciar la expresión de elementos genéticos egoístas como los retrotransposones y así evitar que los productos genéticos de dichas secuencias interfieran con la formación de células germinales. [21] [23]

Notas al pie

  1. ^ La palabra Wimpy proviene de White color of eyes (color blanco de ojos) e Impotencia [o infertilidad profunda]. Se agrega Y como sufijo para formar una palabra más pronunciable y coherente. [5]

Referencias

  1. ^ ab Rivas FV, ​​Tolia NH, Song JJ, et al. (Abril de 2005). "Argonaute2 purificado y un ARNip forman RISC humano recombinante". Nat. Estructura. Mol. Biol . 12 (4): 340–9. doi :10.1038/nsmb918. PMID  15800637. S2CID  2021813.
  2. ^ "Uniprot: La base de datos de conocimiento universal". Investigación en ácidos nucleicos . 45 (D1): D158–D169. 2017. doi :10.1093/nar/gkw1099. PMC 5210571 . PMID  27899622. 
  3. ^ Lindse K (2013). "Piwi-RNAs, los defensores del genoma". {{cite journal}}: Requiere citar revista |journal=( ayuda )
  4. ^ Cox DN, Chao A, Lin H (2000). "piwi codifica un factor nucleoplásmico cuya actividad modula el número y la tasa de división de las células madre de la línea germinal". Desarrollo . 127 (3): 503–14. doi :10.1242/dev.127.3.503. PMID  10631171.
  5. ^ Ross RJ, Weiner MM, Lin H (2014). "Proteínas PIWI y ARN que interactúan con PIWI en el soma". Nature . 505 (7483): 353–359. Bibcode :2014Natur.505..353R. doi : 10.1038/nature12987 . PMC 4265809 . PMID  24429634. 
  6. ^ Lin H, Spradling AC (1997). "Un nuevo grupo de mutaciones de pumilio afecta la división asimétrica de las células madre de la línea germinal en el ovario de Drosophila". Desarrollo . 124 (12): 2463–2476. doi :10.1242/dev.124.12.2463. PMID  9199372.
  7. ^ Cox DN, Chao A, Baker J, Chang L, Qiao D, Lin H (1998). "Una nueva clase de genes conservados evolutivamente definidos por piwi son esenciales para la autorrenovación de las células madre". Genes Dev . 12 (23): 3715–27. doi :10.1101/gad.12.23.3715. PMC 317255 . PMID  9851978. 
  8. ^ Darricarrere N, Liu N, Watanabe T, Lin H (2013). "La función de Piwi, una proteína nuclear Piwi/Argonaute, es independiente de su actividad de segmentación". Proc Natl Acad Sci USA . 110 (6): 1297–1302. Bibcode :2013PNAS..110.1297D. doi : 10.1073/pnas.1213283110 . PMC 3557079 . PMID  23297219. 
  9. ^ ab Zeng, Lei; Zhang, Qiang; Yan, Kelley; Zhou, Ming-Ming (1 de junio de 2011). "Información estructural sobre el reconocimiento de piRNA por el dominio PAZ 1 similar a PIWI humano". Proteínas: estructura, función y bioinformática . 79 (6): 2004–2009. doi :10.1002/prot.23003. ISSN  1097-0134. PMC 3092821 . PMID  21465557. 
  10. ^ Wei, Kai-Fa; Wu, Ling-Juan; Chen, Juan; Chen, Yan-feng; Xie, Dao-Xin (agosto de 2012). "Análisis de evolución estructural y diversificación funcional de la proteína argonauta". Journal of Cellular Biochemistry . 113 (8): 2576–2585. doi :10.1002/jcb.24133. ISSN  1097-4644. PMID  22415963. S2CID  25990631.
  11. ^ Tian Y, Simanshu D, Ma J, Patel D (2010). "Base estructural para el reconocimiento del extremo 3'-O-metilado de piRNA por los dominios Piwi PAZ (Piwi/Argonaute/Zwille)". Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 108 (3): 903–910. doi : 10.1073/pnas.1017762108 . PMC 3024652 . PMID  21193640. 
  12. ^ Qiao D, Zeeman AM, Deng W, Looijenga LH, Lin H (2002). "Caracterización molecular de hiwi, un miembro humano de la familia de genes piwi cuya sobreexpresión está correlacionada con seminomas". Oncogene . 21 (25): 3988–99. doi : 10.1038/sj.onc.1205505 . PMID  12037681.
  13. ^ Deng W, Lin H (2002). "miwi, un homólogo murino de piwi, codifica una proteína citoplasmática esencial para la espermatogénesis". Dev Cell . 2 (6): 819–30. doi : 10.1016/s1534-5807(02)00165-x . PMID  12062093.
  14. ^ Mani S, Juliano C (2013). "Desenredando la red: las diversas funciones de la vía PIWI/piRNA". Mol. Reprod. Dev . 80 (8): 632–664. doi :10.1002/mrd.22195. PMC 4234069. PMID  23712694 . 
  15. ^ Thomson T, Lin H (2009). "La biogénesis y función de las proteínas PIWI y los piRNA: progreso y perspectivas". Annu. Rev. Cell Dev. Biol . 25 : 355–376. doi :10.1146/annurev.cellbio.24.110707.175327. PMC 2780330. PMID  19575643 . 
  16. ^ Cerutti L, Mian N, Bateman A (octubre de 2000). "Dominios en el silenciamiento génico y las proteínas de diferenciación celular: el nuevo dominio PAZ y la redefinición del dominio Piwi". Trends Biochem. Sci . 25 (10): 481–2. doi :10.1016/S0968-0004(00)01641-8. PMID  11050429.
  17. ^ Ma J, Yuan Y, Meister G, Pei Y, Tuschl T, Patel D (2005). "Base estructural para el reconocimiento específico del extremo 5' del ARN guía por la proteína Piwi de A. fulgidus". Nature . 434 (7033): 666–70. Bibcode :2005Natur.434..666M. doi :10.1038/nature03514. PMC 4694588 . PMID  15800629. 
  18. ^ Megosh HB, Cox DN, Campbell C, Lin H (2006). "El papel de PIWI y la maquinaria de miRNA en la determinación de la línea germinal de Drosophila". Curr Biol . 16 (19): 1884–94. Bibcode :2006CBio...16.1884M. doi : 10.1016/j.cub.2006.08.051 . PMID  16949822. S2CID  6397874.
  19. ^ Kim VN (2006). "Los ARN pequeños se han vuelto más grandes: ARN que interactúan con Piwi (piRNA) en testículos de mamíferos". Genes Dev . 20 (15): 1993–7. doi : 10.1101/gad.1456106 . PMID  16882976.
  20. ^ Girard A, Sachidanandam R, Hannon GJ, Carmell MA (2006). "Una clase específica de línea germinal de ARN pequeños se une a las proteínas Piwi de mamíferos". Nature . 442 (7099): 199–202. Bibcode :2006Natur.442..199G. doi :10.1038/nature04917. PMID  16751776. S2CID  3185036.
  21. ^ ab Vagin VV, Sigova A, Li C, Seitz H, Gvozdev V, Zamore PD (2006). "Una ruta de ARN pequeña distinta silencia elementos genéticos egoístas en la línea germinal". Science . 313 (5785): 320–4. Bibcode :2006Sci...313..320V. doi :10.1126/science.1129333. PMID  16809489. S2CID  40471466.
  22. ^ Saito K, Nishida KM, Mori T, Kawamura Y, Miyoshi K, Nagami T, Siomi H, Siomi MC (2006). "Asociación específica de Piwi con rasiRNA derivados de retrotransposones y regiones heterocromáticas en el genoma de Drosophila". Genes Dev . 20 (16): 2214–22. doi :10.1101/gad.1454806. PMC 1553205 . PMID  16882972. 
  23. ^ Ozata DM, Gainetdinov I, Zoch A, Phillip D, Zamore PD (2019). "ARN que interactúan con PIWI: ARN pequeños con grandes funciones" (PDF) . Nature Reviews Genetics . 20 (2): 89–108. doi :10.1038/s41576-018-0073-3. PMID  30446728. S2CID  53565676.

Enlaces externos