La triptófano 2,3-dioxigenasa desempeña un papel central en la regulación fisiológica del flujo de triptófano en el cuerpo humano, como parte del proceso biológico general del metabolismo del triptófano. La TDO cataliza el primer paso, y el que limita la velocidad, de la degradación del triptófano a lo largo de la vía de la quinurenina y, por lo tanto, regula los niveles sistémicos de triptófano. [5] En los seres humanos, la triptófano 2,3-dioxigenasa está codificada por el gen TDO2 . [6]
Función
Esta enzima pertenece a la familia de las oxidorreductasas , específicamente aquellas que actúan sobre donantes únicos con O 2 como oxidante e incorporación de dos átomos de oxígeno al sustrato (oxigenasas). Esta familia incluye la triptófano 2,3-dioxigenasa (TDO, también denominada a veces triptófano oxigenasa y L -triptófano pirrolasa) y la enzima indolamina 2,3-dioxigenasa (IDO), estrechamente relacionada. [7] [8] Tanto la TDO como la IDO contienen un hemo unido de forma no covalente por monómero; la TDO suele ser tetramérica, mientras que la IDO es monomérica.
La triptófano 2,3-dioxigenasa se descubrió inicialmente en la década de 1930 [9] y se encuentra tanto en eucariotas como en procariotas . La expresión de triptófano 2,3-dioxigenasa en mamíferos normalmente está restringida al hígado, pero se ha identificado en el cerebro y el epidídimo de algunas especies y, en algunos tejidos, su producción puede inducirse en respuesta a estímulos. [8] La TDO de rata fue la primera en expresarse de forma recombinante (en E. coli ). [10] También se ha expresado TDO humana. [11] [12]
La misma familia de enzimas también incluye una indol 2,3-dioxigenasa de Shewanella oneidensis [13] y PrnB, la segunda enzima en la vía de biosíntesis de pirrolnitrina de Pseudomonas fluorescens [14] , aunque la actividad dioxigenasa no se ha demostrado para ninguna de ellas hasta el momento. En 2007, se identificó una nueva enzima con la capacidad de catalizar la dioxigenación del L -triptófano, IDO2 [15] .
Estructura
La triptófano 2,3-dioxigenasa es una enzima citosólica que contiene hemo codificada por el gen TDO2. [5] Los estudios cristalográficos de Xanthomonas campestris (TD) [13] y Ralstonia metallidurans (TDO) [16] han revelado que sus estructuras son esencialmente idénticas y son enzimas homotetraméricas íntimamente asociadas . [17] Se describen mejor como un dímero de dímeros porque los residuos N-terminales de cada monómero forman parte del sitio de unión del sustrato en un monómero adyacente. Las proteínas son completamente helicoidales y se observa un bucle flexible, involucrado en la unión del L -triptófano, justo fuera del bolsillo del sitio activo. Este bucle parece estar inducido por la unión del sustrato, ya que se observa solo en cristales cultivados en presencia de L -triptófano. [17]
Hay dos estructuras de TDO disponibles con sustrato (triptófano) unido. [17] , [18]
Mecanismo
Las primeras propuestas para el mecanismo de oxidación del triptófano fueron presentadas por Sono y Dawson. [19] Esto sugirió un mecanismo de abstracción catalizado por bases, que involucra solo el hemo ferroso (Fe II ). Se supone que TDO e IDO reaccionan por el mismo mecanismo, aunque no hay evidencia concreta de eso. En IDO, se ha identificado un hemo ferryl (Fe IV ) durante el recambio. [20] [21] Por lo tanto, las propuestas mecanicistas se han ajustado para incluir la formación de hemo ferryl durante el mecanismo. [22] Se supone que TDO reacciona de la misma manera, pero no se ha observado un hemo ferryl en TDO. Véase también la discusión del mecanismo para la indolamina 2,3-dioxigenasa .
Importancia clínica
Se ha demostrado que la triptófano 2,3-dioxigenasa se expresa en una proporción significativa de tumores humanos . [5] En el mismo estudio, la expresión de triptófano 2,3-dioxigenasa por tumores impidió su rechazo por ratones inmunizados. Un inhibidor de triptófano 2,3-dioxigenasa desarrollado por el grupo restauró la capacidad de estos ratones para rechazar tumores expresados por triptófano 2,3-dioxigenasa, lo que demuestra que los inhibidores de triptófano 2,3-dioxigenasa muestran potencial en la terapia del cáncer.
Otro estudio mostró que la triptófano 2,3-dioxigenasa está potencialmente involucrada en la vía metabólica responsable del comportamiento relacionado con la ansiedad . [23] Generando ratones deficientes en triptófano 2,3-dioxigenasa y comparándolos con el tipo salvaje , el grupo encontró que los ratones deficientes en triptófano 2,3-dioxigenasa mostraron mayores niveles plasmáticos no solo de triptófano, sino también de serotonina y 5-HIAA en el hipocampo y el mesencéfalo . Una variedad de pruebas, como el laberinto en cruz elevado y las pruebas de campo abierto mostraron una modulación ansiolítica en estos ratones knock out , los hallazgos demuestran un vínculo directo entre la triptófano 2,3-dioxigenasa y el metabolismo del triptófano y el comportamiento relacionado con la ansiedad en condiciones fisiológicas.
^ abc ENSG00000151790 GRCh38: Versión 89 de Ensembl: ENSG00000262635, ENSG00000151790 – Ensembl , mayo de 2017
^ abc GRCm38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSMUSG00000028011 – Ensembl , mayo de 2017
^ "Referencia de PubMed humana:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
^ "Referencia PubMed de ratón:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU . .
^ abc Pilotte L, Larrieu P, Stroobant V, Colau D, Dolusic E, Frédérick R, De Plaen E, Uyttenhove C, Wouters J, Masereel B, Van den Eynde BJ (febrero de 2012). "Reversión de la resistencia inmune tumoral mediante inhibición de la triptófano 2,3-dioxigenasa". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 109 (7): 2497–2502. Código Bib : 2012PNAS..109.2497P. doi : 10.1073/pnas.1113873109 . PMC 3289319 . PMID 22308364.
^ "Gen Entrez: TDO2 triptófano 2,3-dioxigenasa".
^ Efimov I, Basran J, Thackray SJ, Handa S, Mowat CG, Raven EL (abril de 2011). "Estructura y mecanismo de reacción en las hemo dioxigenasas". Bioquímica . 50 (14): 2717–2724. doi :10.1021/bi101732n. PMC 3092302 . PMID 21361337.
^ ab Thackray SJ, Bruckmann C, Mowat CG, Forouhar F, Chapman SK, Tong L (2008). "Indolamina 2,3-dioxigenasa y triptófano 2,3-dioxigenasa". Manual de metaloproteínas . doi :10.1002/0470028637.met223.
^ Kotake Y.; Masayama IZ (1936). "Über den Mechanismus der Kynureninbildung aus Tryptophan". Z. Physiol. química . 243 : 237–244. doi :10.1515/bchm2.1936.243.6.237.
^ Ren S, Liu H, Licad E, Correia MA (septiembre de 1996). "Expresión de la triptófano 2,3-dioxigenasa de hígado de rata en Escherichia coli: caracterización estructural y funcional de la enzima purificada". Archivos de bioquímica y biofísica . 333 (1): 96–102. doi :10.1006/abbi.1996.0368. PMID 8806758.
^ Batabyal D, Yeh SR (diciembre de 2007). "Triptófano dioxigenasa humana: una comparación con la indolamina 2,3-dioxigenasa". Revista de la Sociedad Química Estadounidense . 129 (50): 15690–15701. doi :10.1021/ja076186k. PMID 18027945.
^ Basran J, Rafice SA, Chauhan N, Efimov I, Cheesman MR, Ghamsari L, Raven EL (abril de 2008). "Un estudio cinético, espectroscópico y redox de la triptófano 2,3-dioxigenasa humana". Bioquímica . 47 (16): 4752–4760. doi :10.1021/bi702393b. PMID 18370401.
^ ab Forouhar F, Anderson JL, Mowat CG, Vorobiev SM, Hussain A, Abashidze M, Bruckmann C, Thackray SJ, Seetharaman J, Tucker T, Xiao R, Ma LC, Zhao L, Acton TB, Montelione GT, Chapman SK, Tong L (enero de 2007). "Información molecular sobre el reconocimiento y la catálisis del sustrato por la triptófano 2,3-dioxigenasa". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 104 (2): 473–478. Bibcode :2007PNAS..104..473F. doi : 10.1073/pnas.0610007104 . PMC 1766409 . PMID 17197414.
^ De Laurentis W, Khim L, Anderson JL, Adam A, Johnson KA, Phillips RS, Chapman SK, van Pee KH, Naismith JH (octubre de 2007). "La segunda enzima en la vía biosintética de la pirrolnitrina está relacionada con la superfamilia de las dioxigenasas dependientes del hemo". Bioquímica . 46 (43): 12393–12404. doi :10.1021/bi7012189. PMC 3326534 . PMID 17924666.
^ Ball HJ, Sanchez-Perez A, Weiser S, Austin CJ, Astelbauer F, Miu J, McQuillan JA, Stocker R, Jermiin LS, Hunt NH (julio de 2007). "Caracterización de una proteína similar a la indolamina 2,3-dioxigenasa encontrada en humanos y ratones". Gene . 396 (1): 203–213. doi :10.1016/j.gene.2007.04.010. PMID 17499941.
^ Zhang Y, Kang SA, Mukherjee T, Bale S, Crane BR, Begley TP, Ealick SE (enero de 2007). "Estructura cristalina y mecanismo de la triptófano 2,3-dioxigenasa, una enzima hemo implicada en el catabolismo del triptófano y en la biosíntesis de quinolinato". Bioquímica . 46 (1): 145–155. doi :10.1021/bi0620095. PMID 17198384.
^ abc Thackray SJ, Mowat CG, Chapman SK (diciembre de 2008). "Explorando el mecanismo de la triptófano 2,3-dioxigenasa". Biochemical Society Transactions . 36 (Pt 6): 1120–1123. doi :10.1042/bst0361120. PMC 2652831 . PMID 19021508.
^ Lewis-Ballester A, Forouhar F, Kim SM, Lew S, Wang Y, Karkashon S, Seetharaman J, Batabyal D, Chiang BY, Hussain M, Correia MA, Yeh SR, Tong L (octubre de 2016). "Base molecular para la catálisis y la estabilización celular mediada por sustrato de la triptófano 2,3-dioxigenasa humana". Scientific Reports . 6 : 35169. Bibcode :2016NatSR...635169L. doi :10.1038/srep35169. PMC 5071832 . PMID 27762317.
^ Sono M, Roach MP, Coulter ED, Dawson JH (noviembre de 1996). "Oxigenasas que contienen hemo". Chemical Reviews . 96 (7): 2841–2888. doi :10.1021/cr9500500. PMID 11848843.
^ Lewis-Ballester A, Batabyal D, Egawa T, Lu C, Lin Y, Marti MA, Capece L, Estrin DA, Yeh SR (octubre de 2009). "Evidencia de un intermediario ferrilo en una dioxigenasa basada en hemo". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 106 (41): 17371–17376. Bibcode :2009PNAS..10617371L. doi : 10.1073/pnas.0906655106 . PMC 2765089 . PMID 19805032.
^ Yanagisawa S, Yotsuya K, Hashiwaki Y, Horitani M, Sugimoto H, Shiro Y, Appelman EH, Ogura T (2010). "Identificación de las especies hemo Fe-O2 y Fe = O para la indolamina 2,3-dioxigenasa durante el recambio catalítico". Chem Lett . 39 : 36–37. doi :10.1246/cl.2010.36.
^ Basran J, Efimov I, Chauhan N, Thackray SJ, Krupa JL, Eaton G, Griffith GA, Mowat CG, Handa S, Raven EL (octubre de 2011). "El mecanismo de formación de N-formilquinurenina por hemo dioxigenasas". Revista de la Sociedad Química Estadounidense . 133 (40): 16251–16257. doi :10.1021/ja207066z. PMC 3210546 . PMID 21892828.
^ Kanai M, Funakoshi H, Takahashi H, Hayakawa T, Mizuno S, Matsumoto K, Nakamura T (marzo de 2009). "La triptófano 2,3-dioxigenasa es un modulador clave de la neurogénesis fisiológica y del comportamiento relacionado con la ansiedad en ratones". Molecular Brain . 2 (8): 8. doi : 10.1186/1756-6606-2-8 . PMC 2673217 . PMID 19323847.
Lectura adicional
Comings DE, Muhleman D, Dietz GW, Donlon T (febrero de 1991). "Triptófano oxigenasa humana localizada en 4q31: posibles implicaciones para el alcoholismo y otros trastornos del comportamiento". Genomics . 9 (2): 301–308. doi :10.1016/0888-7543(91)90257-F. PMID 2004780.
Comings DE, Muhleman D, Dietz G, Sherman M, Forest GL (septiembre de 1995). "Secuencia de la triptófano 2,3-dioxigenasa humana (TDO2): presencia de un elemento similar a la respuesta a los glucocorticoides compuesto por una repetición GTT y una repetición CCCCT intrónica". Genomics . 29 (2): 390–396. doi :10.1006/geno.1995.9990. PMID 8666386.
Dick R, Murray BP, Reid MJ, Correia MA (agosto de 2001). "Relaciones estructura-función de la triptófano 2,3-dioxigenasa hepática de rata: identificación de los supuestos residuos de histidina ligados al hemo". Archivos de bioquímica y biofísica . 392 (1): 71–78. doi :10.1006/abbi.2001.2420. PMID 11469796.
Kudo Y, Boyd CA, Sargent IL, Redman CW (marzo de 2003). "Disminución del catabolismo del triptófano por la indolamina 2,3-dioxigenasa placentaria en la preeclampsia". American Journal of Obstetrics and Gynecology . 188 (3): 719–726. doi :10.1067/mob.2003.156. PMID 12634647.
Nabi R, Serajee FJ, Chugani DC, Zhong H, Huq AH (febrero de 2004). "Asociación del polimorfismo del gen de la triptófano 2,3 dioxigenasa con el autismo". American Journal of Medical Genetics. Parte B, Neuropsychiatric Genetics . 125B (1): 63–68. doi :10.1002/ajmg.b.20147. PMID 14755447. S2CID 26302464.
Guillemin GJ, Smythe G, Takikawa O, Brew BJ (enero de 2005). "Expresión de indolamina 2,3-dioxigenasa y producción de ácido quinolínico por microglia, astrocitos y neuronas humanas". Glia . 49 (1): 15–23. doi :10.1002/glia.20090. PMID 15390107. S2CID 31823904.
Baharvand H, Hashemi SM, Kazemi Ashtiani S, Farrokhi A (2006). "Diferenciación de células madre embrionarias humanas en hepatocitos en sistemas de cultivo 2D y 3D in vitro". Revista Internacional de Biología del Desarrollo . 50 (7): 645–652. doi : 10.1387/ijdb.052072hb . PMID 16892178.
Batabyal D, Yeh SR (diciembre de 2007). "Triptófano dioxigenasa humana: una comparación con la indolamina 2,3-dioxigenasa". Journal of the American Chemical Society . 129 (50): 15690–15701. doi :10.1021/ja076186k. PMID 18027945.
Gupta R, Fu R, Liu A, Hendrich MP (2007). "La espectroscopia EPR y Mossbauer muestra hemo no equivalentes en la triptófano dioxigenasa". Journal of the American Chemical Society . 132 (3): 1098–1109. doi :10.1021/ja908851e. PMC 4251817 . PMID 20047315.
Allegri G, Ragazzi E, Bertazzo A, Costa CV, Rocchi R (2003). "Metabolismo del triptófano a lo largo de la vía de la quinurenina en ratas". Avances en el metabolismo del triptófano y la serotonina . Avances en medicina y biología experimental. Vol. 527. págs. 481–496. doi :10.1007/978-1-4615-0135-0_56. ISBN .978-1-4613-4939-6. Número de identificación personal 15206766.
Chung LW, Li X, Sugimoto H, Shiro Y, Morokuma K (septiembre de 2008). "Estudio de la teoría funcional de la densidad sobre una pieza faltante en la comprensión de la química del hemo: el mecanismo de reacción de la indolamina 2,3-dioxigenasa y la triptófano 2,3-dioxigenasa". Journal of the American Chemical Society . 130 (37): 12299–12309. doi :10.1021/ja803107w. PMID 18712870.
Allegri G, Ragazzi E, Bertazzo A, Biasiolo M, Costa CV (2003). "Metabolismo del triptófano en conejos". Desarrollos en el metabolismo del triptófano y la serotonina . Avances en Medicina y Biología Experimentales. vol. 527, págs. 473–479. doi :10.1007/978-1-4615-0135-0_55. ISBN 978-1-4613-4939-6. Número de identificación personal 15206765.